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恭喜中国农业科学院北京畜牧兽医研究所高雪获国家专利权

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龙图腾网恭喜中国农业科学院北京畜牧兽医研究所申请的专利一种肉牛核心种质的构建方法及其应用获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119339790B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-22发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411864715.1,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种肉牛核心种质的构建方法及其应用是由高雪;李俊雅;王兢;杜振伟;王元清设计研发完成,并于2024-12-18向国家知识产权局提交的专利申请。

一种肉牛核心种质的构建方法及其应用在说明书摘要公布了:本发明涉及动物育种技术领域,特别是涉及一种肉牛核心种质的构建方法及其应用。本发明提供的构建方法包括:1)获取待构建核心种质肉牛品种的基因型数据;2)对得到的基因型数据进行质量控制和填充,筛选公共SNP位点;3)利用公共SNP位点计算个体对群体的遗传距离,建立离群个体的剔除标准,构建肉牛品种的初级核心种质;4)采用CoreHunter3算法进行最佳比例的核心种质搜索,构建肉牛品种核心种质。本发明提供的构建方法能够以最小数量种质最大限度地代表每个种质资源的遗传多样性,极大地减少了肉牛种质资源保存的工作量,而且对种群血统的纯度分析有一定的促进作用。

本发明授权一种肉牛核心种质的构建方法及其应用在权利要求书中公布了:1.一种肉牛核心种质的构建方法,其特征在于,包括以下步骤:1)获取待构建核心种质肉牛品种的基因型数据;所述基因型数据为基因组SNP位点的基因分型数据;2)对步骤1)中所述基因型数据进行质控,并对缺失的SNP位点进行填充,得到具有公共SNP位点的肉牛个体集,记为原始种质;所述质控的标准包括:只保留常染色体位点,剔除分型成功率<90%和最小等位基因频率<0.05的位点,同时剔除检出率<90%,哈代温伯格平衡检测P<1×10-6的个体;3)利用步骤2)中所述的公共SNP位点,根据式Ⅰ计算所述原始种质中每个品种内的个体对品种群体的平均遗传距离,运用四分位数检验法建立离群个体的剔除标准,剔除各品种内遗传差异较大的个体,得到肉牛品种的初级核心种质;式Ⅰ;其中,Di为平均遗传距离;N为品种内的个体数目,单位:个;dij为个体间的遗传距离;所述剔除标准为:DiUQ+(1.5~2)IQR;其中,IQR=UQ-LQ,UQ为上四分位数,LQ为下四分位数;4)采用CoreHunter3算法对步骤3)得到的初级核心种质对应的基因型数据进行全局搜索,评价参数选取EN和SH,EN和SH的权重比为1:1,利用式Ⅱ将EN和SH的评价参数组合在一起,对核心种质进行筛选,得到肉牛品种核心种质;式Ⅱ;其中,F(C)为核心种质的综合评价值;Fi(c)为第i个参数的评价函数,默认归一化为[0,1];αi为该参数的权重;所述筛选的标准包括:选取核心种质的最大数量不超过该品种原始种质的60%以及肉牛核心种质的基因覆盖度≥99%的集合,在所述集合中选择期望杂合度最大的子集;若取样比例达到原始种质的60%,基因覆盖度仍小于99%时,选取最大取样比例的子集作为肉牛核心种质。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,其通讯地址为:100193 北京市海淀区圆明园西路2号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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