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龙图腾网恭喜南京农业大学申请的专利一种高效预测切花菊株高性状SNP位点及其方法和应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116769956B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-22发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310732375.6，技术领域涉及：C12Q1/6895；该发明授权一种高效预测切花菊株高性状SNP位点及其方法和应用是由张飞;张雪峰;苏江硕;管志勇;房伟民;陈发棣设计研发完成，并于2023-06-20向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种高效预测切花菊株高性状SNP位点及其方法和应用在说明书摘要公布了：本发明公开了一种高效预测切花菊株高性状SNP位点，还公开了高效预测切花菊株高性状SNP位点方法及其应用。本发明使用数量多、分布广泛、能够稳定遗传且易于高通量基因分型的SNP标记进行切花菊株高相关性状全基因组关联分析，结果表明，与株高性状相关的最佳标记对株高、节间数、节间长度和茎粗的预测准确度分别为0.97、0.98、0.97和0.96，可以应用于切花菊株高、节间长度、节间数和茎粗的早期预测，缩短育种周期，为菊花株高相关性状功能标记的开发和遗传改良提供了位点信息，对于选育不同株型菊花优良材料具有重要理论和实践意义。

本发明授权一种高效预测切花菊株高性状SNP位点及其方法和应用在权利要求书中公布了：1.一种高效预测切花菊株高相关性状的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：选取来源不同且无直接亲缘关系的切花菊品种，于生长末期在不同环境下统计该群体的株高相关性状；步骤2：对步骤1统计的切花菊性状进行描述性统计及方差分析，并计算出各性状的广义遗传力；步骤3：采用GBSgenotyping-by-sequencing对步骤1中的切花菊品种进行基因型分型，利用BWA软件将cleanreads比对到菊花参考基因组，采用SAMTOOLS软件进行SNPcalling，利用VCFtools软件对检测到的SNP过滤，获得的高质量SNP用于全基因组关联分析；步骤4：基于步骤1获得的表型数据和步骤3获得的基因型数据进行全基因组关联分析，依据显著性阈值筛选与各个性状显著关联的SNP；步骤5：对切花菊株高相关性状进行全基因组选择分析，通过比较不同SNP标记集的预测准确度，确定最佳标记集，筛选符合育种值需求材料；其中，所述步骤1中切花菊株高相关性状为切花菊株高、节间数、节间长度或茎粗中任意一种；所述步骤2中的切菊花表型数据分析方差分析模型为Yij＝μ+Gi+Yj+GYij+eij，其中Yij为表型观测值，μ为多个环境下的均值，Gi为基因型效应，Yj为环境效应，GYij为基因型与环境互作效应，eij为随机误差，依据方差分析的结果计算各性状广义遗传力H2，其表达式为H2＝σ2gσ2g+σ2ge+σ2ern，σ2g为基因型方差，σ2ge为基因型与环境互作方差，σ2e为残差方差，n为环境个数，r为单个环境的重复数；所述步骤4对不同环境下的切菊花性状进行全基因组关联分析，计算出每个SNP位点的显著度即P值，将P1×10-5作为显著关联的阈值筛选出潜在的候选SNPs；所述步骤5，根据筛选出的最佳SNP标记集，利用公式Y＝μ+Xg+e估计每个不同切花菊品种株高育种值GEBV；其中Y为预测表型值，μ为训练群体表型均值，X为测试群体表型均值，g为标记效应矩阵，e为随机效应矩阵；当切花菊品种株高的育种值大于80cm时，该品种可作为优质株高相关性状的切花菊品种。

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