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恭喜浙江大学郭国骥获国家专利权

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龙图腾网恭喜浙江大学申请的专利一种单细胞的跨物种细胞类型鉴定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115064220B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202210677411.9,技术领域涉及:G16B50/00;该发明授权一种单细胞的跨物种细胞类型鉴定方法是由郭国骥;张霈婧;孙慧宇;汪仁英;马立枫;鄂唯高;王晶晶设计研发完成,并于2022-06-14向国家知识产权局提交的专利申请。

一种单细胞的跨物种细胞类型鉴定方法在说明书摘要公布了:本发明公开了一种单细胞的跨物种细胞类型鉴定方法,属于单细胞数据分析领域。本发明整合了多个代表性物种的单细胞转录组全图谱,构建了迄今为止最大的单细胞参考数据库,包含无偏好性且覆盖较为全面的多种细胞类型。本发明弥补了以群体基因表达数据为基础的细胞鉴定的缺陷和没有标准参考数据库的困扰,为跨物种分析提供数据支撑。通过同源基因比对、特征基因的提取和基因表达模式相似性的计算,本发明消除了不同测序平台、不同物种乃至不同细胞类型间的单细胞数据测序深度的影响,在高正确率和快速运算之间取得了平衡,并首次实现跨物种细胞类型的鉴定。本发明提供的方法对未知细胞类型鉴定及跨物种分析具有重要指导意义。

本发明授权一种单细胞的跨物种细胞类型鉴定方法在权利要求书中公布了:1.一种单细胞的跨物种细胞类型鉴定方法,其特征在于,包括以下步骤:1收集不同物种的单细胞转录组图谱数据集,根据数据集注释信息对细胞类型进行整理,统一命名方式和规则;2对不同物种单细胞图谱数据的基因表达矩阵进行RPKM标准化处理,获得每个基因在不同细胞中的标准化表达数值;针对每个细胞类型,根据基因的标准化表达数值进行差异基因表达分析,获取每个细胞类型相较于其他细胞类型特异性高表达的特征基因;3对于每个物种,选取每个细胞类型前若干个差异表达基因,合并作为参考数据集使用的特征基因集,即为细胞类型参考数据库;4待测数据集细胞类型的鉴定:4.1收集待测物种间已注释的同源基因;对于待测物种间未知的同源基因,从公开数据库中下载待测物种已注释的基因编码区域,或预测未知同源基因的编码区域;输入待测物种的基因编码区域文件,预测待测物种的同源基因;4.2细胞类型相似性分数计算:按照步骤2对待测数据集进行标准化处理;根据步骤4.1中物种间的同源基因,对待测数据集表达矩阵进行同源基因转换,获得新的基因表达矩阵;基于查询目标物种的细胞类型参考数据库中,提取特征基因集的表达值;计算待测数据集表达矩阵与细胞类型参考数据库查询目标之间的细胞类型的相似性分数;依据每个细胞类型所包含的细胞信息,统计待测数据集中的细胞类型与细胞类型参考数据库细胞类型间的相似性分数,将具有最高相似性分数的细胞类型作为该待测数据集细胞类型的鉴定结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人浙江大学,其通讯地址为:310058 浙江省杭州市西湖区余杭塘路866号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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