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龙图腾网恭喜南京农业大学申请的专利一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN114974410B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-03发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202210596560.2，技术领域涉及：G16B20/00；该发明授权一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法是由江高飞;韦中;张耀中;徐阳春;沈其荣设计研发完成，并于2022-05-30向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法在说明书摘要公布了：本发明公开了一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法，其步骤为：步骤一、构建MGEs数据库；步骤二、构建非冗余蛋白质集合；步骤三、使用ReadsMapping的方法对非冗余蛋白质集合进行MGEs信息注释，获取MGEs物种溯源信息；步骤四、通过筛选并去除冗余后构建MGEs物种溯源数据库；步骤五、对MGEs物种溯源数据库封装，搭建分析平台；步骤六、采集环境样品进行DNA抽提建库，用Illumina测序技术进行宏基因组测序分析，获取原始数据；步骤七、原始数据使用FastQC进行质控并去除人类基因组污染，获取质控数据Cleandata；步骤八、质控数据输入分析平台，获取MGEs物种溯源丰度表。本发明大大提高了MGEs分析的速度以及准确性，实现了基于宏基因组测序数据进行MGEs物种溯源的快速分析。

本发明授权一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法在权利要求书中公布了：1.一种土壤细菌可移动遗传元件的宏基因组溯源分析方法，其特征在于包括如下步骤：步骤一、构建MGEs数据库；整合公共数据库中所有的MGEs序列，对其进行结构化信息整理并去除冗余序列，获取非冗余个性化MGEs数据库用于MGEs物种溯源；步骤二、构建非冗余蛋白质集合；从公共数据库中收集12w+个参考基因组的编码蛋白，使用cd-hit软件去冗余获取物种非冗余编码基因集；使用Prodigal对非冗余编码基因集蛋白质预测，获取对应的物种非冗余蛋白质集；具体步骤如下：步骤1：收集公共数据库中细菌参考基因组编码蛋白序列后合并；步骤2：将合并后的基因集按照物种的分类去除冗余序列；步骤3：对非冗余编码基因集预测，构建非冗余蛋白质集；步骤三、使用ReadsMapping的方法对非冗余蛋白质集合进行MGEs信息注释，获取MGEs物种溯源信息；将非冗余蛋白质集与自行构建的MGEs数据库进行ReadsMapping比对，使用标准筛选匹配上的序列，并打上物种标签，实现MGEs数据库的物种信息匹配；步骤四、通过筛选并去除冗余后构建MGEs物种溯源数据库；步骤五、对MGEs物种溯源数据库封装，搭建分析平台；利用ARGs-OAP软件，并基于Perl语言脚本封装MGEs物种溯源数据库，完成宏基因组溯源土壤可移动遗传元件分析平台搭建；将宏基因组质控后得到的Cleandata输入完成封装的分析平台，将实现可移动遗传元件的物种溯源注释与定量分析；定量分析方法为：通过ARGs-OAP中自带的USEARCH+BLASTX比对MGEs物种溯源数据库的方式对宏基因组测序reads进行比对和定量，即所有样品的质控数据使用BLASTX比对MGEs物种溯源数据库，获取可移动遗传元件计算每个基因每个样品的reads丰度；最终的结果的丰度定量单位为每百万条reads中匹配基因的reads数目；步骤六、采集环境样品进行DNA抽提建库，用Illumina测序技术进行宏基因组测序分析，获取原始数据；步骤七、原始数据使用FastQC进行质控并去除人类基因组污染，获取质控数据Cleandata；步骤八、质控数据输入分析平台，获取MGEs物种溯源丰度表。

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