恭喜北京航空航天大学邓岳获国家专利权
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龙图腾网恭喜北京航空航天大学申请的专利一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119889440B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510361237.0,技术领域涉及:G16B25/10;该发明授权一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统是由邓岳;李博翰;李洪珏设计研发完成,并于2025-03-26向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统在说明书摘要公布了:本发明公开了一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统,该方法包括:基于空间邻域关系构建细胞微环境图,建立细胞位置与基因表达的关联网络;通过随机微分方程建模细胞位置及基因表达随深度的连续动态变化;利用图神经网络学习空间梯度,分别预测形状漂移系数和表达漂移系数;采用双向推断策略联合优化插值结果,通过Wasserstein距离和均方误差约束形状与表达的对齐精度;整合插值切片生成连续三维转录图谱。本发明通过融合扩散模型与图神经网络,实现对z轴切片数据的连续性补全,实现了对组织三维基因表达的高分辨率重建,可精准解析肿瘤边界、脑区功能分区等复杂空间生物学问题,为病理诊断、发育研究和药物开发提供关键技术支撑。
本发明授权一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统在权利要求书中公布了:1.一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法,其特征在于,包括以下步骤:1).构建三维空间测序数据的细胞微环境图:对K张沿z轴分布的切片数据,利用KNN算法确定每个细胞的空间邻域关系,生成包含空间坐标和基因表达的图结构数据集;2).建立随机微分方程模型:基于所述图结构数据集建模细胞位置随z轴深度连续变化的随机微分方程模型,作为形状漂移方程;并建模基因表达随z轴深度连续变化的随机微分方程模型,作为基因表达漂移方程;3).训练图神经网络:a.构建并训练形状预测网络:输入当前切片的空间坐标及空间邻域关系,输出形状漂移系数,代入形状漂移方程,预测细胞在下一层切片的位置偏移;b.构建并训练表达预测网络:输入当前切片的空间坐标、基因表达及空间邻域关系,输出表达漂移系数,代入基因表达漂移方程,推测基因表达量的变化趋势;4).双向插值优化:利用训练好的图神经网络来进行插值预测,通过正向和反向插值生成中间切片,联合优化形状分布的Wasserstein距离和基因表达的均方误差损失;5).构建三维转录连续体:整合插值切片数据,生成连续的三维基因表达图谱。
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