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含有O-缩醛乙酰丙酸酯基团(O-acetal levulinyl ester)的RNA单体及其在RNA微阵列中的应用 

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申请/专利权人:高端学术皇家研究会/麦吉尔大学;威斯康星校友研究基金会

摘要:本发明涉及在核糖的2’和或5’羟基官能团上含有O-缩醛乙酰丙基酯基团的RNA单体。所述的单体可以包括于寡聚核糖核苷酸或者RNA聚核苷酸中。此外,本发明涉及合成所述的RNA单体、寡聚核糖核苷酸以及RNA聚核苷酸的方法,以及其脱保护的方法,以及所述化合物和包括所述化合物的组合物的使用方法。具体地,该化合物和包括其的组合物用于RNA微阵列的光导向合成的方法中。

主权项:一种式I的化合物或其盐:其中,B选自6‑氨基‑9H‑嘌呤‑9‑基、2‑氨基‑1H‑嘌呤‑69H‑酮‑9‑基、4‑氨基嘧啶‑21H‑酮‑1‑基、嘧啶‑2,41H,3H‑二酮‑1‑基、N4‑乙酰丙酰基胞嘧啶、N2‑乙酰丙酰基鸟嘌呤、N2‑二甲基甲脒鸟嘌呤、N2‑苯氧基乙酰基鸟嘌呤、N6‑叔丁基苯氧乙酰基腺嘌呤、N6‑9‑芴基甲氧羰基腺嘌呤、N2‑9‑芴基甲氧羰基鸟嘌呤、N4‑苯甲酰基胞嘧啶、N6‑苯甲酰基腺嘌呤、N4‑异丁酰基胞嘧啶、N4‑乙酰基胞嘧啶和N2‑异丁酰基鸟嘌呤;P1是氢或O‑保护基:–CH2OCOCH2CH2COCH3;P2是氢或或者其中R是甲基、2‑氰乙基、2‑氯苯基、4‑氯苯基;P3是氢或选自下述基团的O‑保护基:a.碱不稳定基团:–CH2OCOCH2CH2COCH3和–COCH2CH2COCH3;b.酸不稳定基团:O‑双2‑乙酰氧基乙氧基甲基、1‑2‑氟苯基‑4‑甲氧基哌啶‑4‑基、1‑4‑氯苯基‑4‑乙氧基哌啶‑4‑基、4‑N‑二氯乙酰基‑N‑甲氨基苄氧基甲基、二甲氧基三苯甲基和单甲氧基三苯甲基;c.易还原基团:2‑叔丁基二硫代甲基和烯丙基;d.氟化物不稳定基团:叔丁基二甲基硅烷基、2'‑O‑三异丙基硅氧甲基、氰乙基甲基和2‑4‑甲苯磺酰基乙氧基甲基;和e.光不稳定基团:2‑2‑硝基苯基丙氧羰基、α‑甲基硝基胡椒基氧羰基、噻吨酮‑硝基苄基缀合物和5'‑O‑二甲氧基苯偶姻碳酸盐基;和其中,P1和P3中的一个是作为O‑保护基的–CH2OCOCH2CH2COCH3。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 高端学术皇家研究会/麦吉尔大学 威斯康星校友研究基金会 含有O-缩醛乙酰丙酸酯基团(O-acetal levulinyl ester)的RNA单体及其在RNA微阵列中的应用

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