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采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法 

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申请/专利权人:贵州大学

摘要:本发明公开了一种采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法。本发明具有操作简便、快速高效、敏感性高、特异性强、有效解决了PCR污染、PCR热不稳定的问题、自动化程度高等特点,比采用其它方法适应性更强、效果更好。且本发明简单易懂,便于操作。

主权项:1.一种采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:包括如下步骤:1提取屠宰后的发情期产单羔、产多羔的黔北麻羊母羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢10个性腺组织的总RNA;采用超微量分光光度计与1%琼脂糖凝胶电泳检测提取总RNA的特异性、完整性以及纯度;2对提取的符合要求的总RNA依据逆转录试剂盒合成cDNA第一链;并以逆转录后的cDNA第一链为模板,分别对目的基因CTSB和内参基因β-actin进行普通PCR扩增;3目的基因CTSB上游引物的序列为5'-TGACTCGCATGTAGGTTGC-3'、下游引物的序列为5'-TGGAGACGCTGTAGGAA-3';内参基因β-actin上游引物的序列为5'-AGATGTGGATCAGCAAGCAG-3'、下游引物的序列为5'-CCAATCTCATCTCGTTTTCTG-3';PCR扩增产物使用1.5%琼脂糖凝胶电泳进行检测。4将电泳检测出的目的条带切下,切胶回收产物与pMD19-T载体连接,再转化为大肠杆菌DH5α感受态细胞,经蓝白斑筛选后,将鉴定为阳性的菌液进行测序,将测序正确的菌液进行扩繁与质粒提取工作,并将获得的重组质粒进行定量稀释,以稀释后的重组质粒作为模板,采用实时荧光定量PCR扩增目的基因CTSB与内参基因β-actin,获得标准曲线与熔解曲线;利用2-ΔΔCt相对定量法计算目的基因CTSB的相对表达量,并检测差异表达量。

全文数据:采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法技术领域本发明涉及生物科学技术领域,特别涉及到采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法。背景技术CTSBCathepsinB,组织蛋白酶B属于溶酶体半胱氨酸抑制剂蛋白酶家族成员,与不同的生化功能和病理障碍有着紧密联系。如在适宜pH贵州大学采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法4SIPOSequenceListing1.0119DNA山羊Nelumbonucifera1tgactcgcatgtaggttgc19217DNA山羊Nelumbonucifera2tggagacgctgtaggaa17320DNA山羊Nelumbonucifera3agatgtggatcagcaagcag20421DNA山羊Nelumbonucifera4ccaatctcatctcgttttctg21

权利要求:1.一种采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:包括如下步骤:1提取屠宰后的发情期产单羔、产多羔的黔北麻羊母羊下丘脑、垂体、子宫、输卵管和卵巢10个性腺组织的总RNA;采用超微量分光光度计与1%琼脂糖凝胶电泳检测提取总RNA的特异性、完整性以及纯度;2对提取的符合要求的总RNA依据逆转录试剂盒合成cDNA第一链;并以逆转录后的cDNA第一链为模板,分别对目的基因CTSB和内参基因β-actin进行普通PCR扩增;3目的基因CTSB上游引物的序列为5'-TGACTCGCATGTAGGTTGC-3'、下游引物的序列为5'-TGGAGACGCTGTAGGAA-3';内参基因β-actin上游引物的序列为5'-AGATGTGGATCAGCAAGCAG-3'、下游引物的序列为5'-CCAATCTCATCTCGTTTTCTG-3';PCR扩增产物使用1.5%琼脂糖凝胶电泳进行检测。4将电泳检测出的目的条带切下,切胶回收产物与pMD19-T载体连接,再转化为大肠杆菌DH5α感受态细胞,经蓝白斑筛选后,将鉴定为阳性的菌液进行测序,将测序正确的菌液进行扩繁与质粒提取工作,并将获得的重组质粒进行定量稀释,以稀释后的重组质粒作为模板,采用实时荧光定量PCR扩增目的基因CTSB与内参基因β-actin,获得标准曲线与熔解曲线;利用2-ΔΔCt相对定量法计算目的基因CTSB的相对表达量,并检测差异表达量。2.根据权利要求1所述的采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:步骤2中对目的基因CTSB和内参基因β-actin进行扩增时,PCR程序为:预变性95℃5min,95℃变性30s,55℃退火45s,72℃延伸30s,72℃终延伸7min;反应体系为20μL,其中包括:2xTaqPCRMasterMix10μL,DNA模板2μL,上、下游引物各1μL,ddH2O6μL。3.根据权利要求1所述的采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:步骤4中切胶回收产物与pMD-19T载体进行连接的体系为10μL,其中包括pMDTM19-TVector1μL,切胶回收产物4μL,SolutionI连接酶5μL,16℃金属浴连接12h。4.根据权利要求1所述的采用实时荧光定量PCR技术检测黔北麻羊CTSB基因组织表达谱的方法,其特征在于:步骤4中转化为大肠杆菌感受态细胞的方法如下:1将大肠杆菌DH5α感受态细胞置于冰上解冻后轻轻摇晃将细胞悬浮;2将金属浴过夜连接的连接液加入大肠杆菌DH5α感受态细胞中,并用枪头轻轻将细胞与连接液混匀,放置冰上静置20min;3在将其放入42℃水浴锅内恒温加热90s,加热后放置冰上冷却10min;4向试管中加入普通液体培养基,放置摇箱内以37℃,200rpm振荡1h;5振荡后的体液放入冷冻离心机中5000rpm离心5min,离心管底部有细胞析出,用枪头吸掉上清液,用枪头来回吹打剩余的培养基将细胞与培养基混匀;6将细胞悬液均匀的涂在含有X-gal和IPTG的含AMP的固体培养基平板上;7将平板放置37℃恒温箱内1h,待平板表面液体干后倒置培养12-16h。

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