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经修饰的CULLIN1基因 

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申请/专利权人:瑞克斯旺种苗集团公司

摘要:本发明涉及经修饰的Cullin1基因,其导致使得能够高效栽培和或适合于需要较小部分,或者减少涉及储存、处理和运输多余植物叶子的劳力、时间和费用的情况的植物类型。本发明还涉及包含所述经修饰的Cullin1基因的植物。该经修饰的Cullin1基因为植物提供了紧凑生长表型,即与不包含所述经修饰的Cullin1基因的植物相比包含较短的节间长度和或较小的叶面积。本发明还涉及该经修饰的Cullin1基因用于鉴定和开发显示紧凑生长表型即包含较短的节间和或较小的叶面积的植物的用途。

主权项:1.一种经修饰的Cullin1基因,其在SEQIDNo:1的野生型Cullin1核苷酸序列中的修饰导致SEQIDNo:18的野生型Cullin1氨基酸序列内的变化;其中所述核苷酸序列的修饰是SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147处从腺嘌呤至鸟嘌呤的变化的SNP,或导致SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置49处从异亮氨酸至甲硫氨酸的氨基酸变化的修饰。

全文数据:经修饰的CULLIN1基因[0001]本发明涉及能够有效栽培的植物类型,以及用于鉴定和开发这种植物的方法。本发明还涉及适合于需要较小部分,或者减少涉及多余植物叶子的储存、处理和运输的劳力、时间和费用的情况的植物类型,以及用于鉴定和开发这种植物的方法。[0002]植物育种者不断寻找更高效的方式栽培植物。提高效率的一种方法是高线材栽培high-wirecultivation。在高线材栽培中,采用更高的种植密度来获得更高的产量m2。另外,高线材栽培允许更长的植物产生水果的栽培期。黄瓜和番茄是适合高线材栽培的农作物。然而,并非所有品种都适合这种类型的栽培。[0003]如果植株具有紧凑生长compactgrowth表型,也可在其它作物中实现更高效的栽培。这种紧凑生长表型的特征可能在于植株显示较短的节间和或较小的叶面积。由于这种紧凑生长表型,植物可以以较高的密度种植,从而节省大量的空间。[0004]本发明的一个目的是提供能够进行高效栽培的植物类型。通过提供显示紧凑生长表型的植物类型已经实现了该目标。[0005]在导致本发明的研究中,发现CulIini基因中的突变导致植物类型的改变,其可以表达为紧凑生长表型。具有该突变基因的植物特别适合于高效栽培。这种植物显示较短的节间长度和或较小的叶面积,并且还可显示导致紧凑生长表型的其它特征。[0006]Cullin蛋白是存在于所有真核生物不仅仅是植物)中的蛋白质家族。Cullin蛋白与RING蛋白组合形成所谓的CulIin-RING遍在蛋白连接酶CRL。通常,CulIin蛋白在蛋白质遍在蛋白化和蛋白质降解中起重要作用。[0007]遍在蛋白化也称为泛素化是一个酶促翻译后修饰过程,其中遍在蛋白被连接至底物蛋白质。[0008]遍在蛋白是一种高度保守的小分子多肽,普遍存在于真核生物中。依赖于ATP的反应级联涉及遍在蛋白活化Bls、遍在蛋白缀合;E2s和遍在蛋白-蛋白质连接酶;E3s的依次作用)进行遍在蛋白与其它蛋白质的连接。与遍在蛋白连接的蛋白质随后被降解并分解或重新定位。[0009]作为Cullin蛋白家族的成员的Cullinl蛋白是组成SCF复合物的四个亚单位中的一个。缩写SCF代表SKPl-CULl-F-box蛋白E3遍在蛋白连接酶复合物,其介导参与细胞周期进程、信号转导和转录的蛋白质的遍在蛋白化。在SCF复合物中,Cullinl可用作组织SKPl-F-box蛋白和RBXl亚单位的刚性支架。其可通过定位底物和遍在蛋白缀合酶来促成催化作用。[0010]如前所述,Cullin蛋白存在于所有真核生物中。通过参与遍在蛋白化和随后的过程,其参与了广泛的细胞过程。令人惊奇的是,本发明的突变导致较短的节间长度和或较小的叶面积,而不会对植物造成基于由Cullinl蛋白质及其功能的保守状态可获得的现有技术水平知识将会预期到的有害影响。[0011]在本研究中对经修饰的Cullinl基因的表征在黄瓜黄瓜Cucumissativus中进行。这使得能够鉴定具有Cullinl基因的其它作物,所述基因在被修饰时导致具有紧凑生长表型的植物,即显示较短的节间长度和或较小的叶面积,或者当与不具有该经修饰的CulIini基因的植物相比较时其它植物部分的减小。这些作物包括属于萌芦科Cucurbitacea的那些植物,诸如例如甜瓜(Cucumismelo、西瓜(CitrullusIanatus和舆瓜squash西萌芦Cucurbitapepo;水果作物诸如辣椒辣椒Capsicumannuum、番前(Solanumlycopersicum和前子(前子(Solanummelongena;叶菜,诸如萬苣(萬苣Lactucasativa、菠菜(Spinaciaoleracea,菊苣(Cichoriumintybus和卷心菜(甘蓝(Brassica〇Ieracea;根菜,诸如例如胡萝卜(胡萝卜(Daucuscarota、萝卜(萝卜Raphanussativus和甜菜根甜菜;Betavulgaris等;和其它作物,诸如序菜(序菜Apiumgraveolens和韭葱(韭葱(Alliumampeloprasum〇[0012]本发明的另一个目的是提供适合于需要较小部分的情况或者减少涉及多余植物叶子的储存、处理和运输的劳力、时间和费用的植物类型。[0013]本发明因此涉及经修饰的Cullinl基因,其包含野生型Cullinl核苷酸序列中的修饰,所述修饰导致野生型CulIini氨基酸序列的修饰。[0014]CulIini基因可以通过本领域已知的不同方式进行修饰,包括诱变。诱变包括通过一种或多种化合物,例如甲磺酸乙酯EMS、亚硝基甲基脲、羟胺、原黄素、N-甲基-N-亚硝基胍、N-乙基-N-亚硝基脲、N-甲基-N-硝基-亚硝基胍、硫酸二乙酯、乙烯亚胺、叠氮化钠、福尔马林、氨基甲酸乙酯、苯酚和环氧乙烷,和或通过物理手段诸如紫外线照射、快中子暴露、X射线、γ照射和或通过插入遗传元件诸如转座子、T-DNA、逆转录病毒元件来向DNA随机引入至少一个修饰。诱变还包括通过同源重组、基于寡核苷酸的突变诱导、锌指核酸酶ZFN、转录激活因子样效应物核酸酶TALEN或成簇的规律间隔的短回文重复序列CRISPR系统更特异地靶向引入至少一个修饰。[0015]经修饰的Cullinl基因可以是通过转基因方法或同源转基因方法引入植物的外源Cullinl基因。使用本发明的经修饰的Cullinl基因来开发显示紧凑生长表型(即包含更短的节间和或更小的叶面积)的植物包括通过转基因或同源转基因方法引入经修饰的外源Cullinl基因。[0016]经修饰的Cullinl基因可以是基因构建体的一部分,该基因构建体包含选择标记、启动子序列、Cullinl基因序列和终止子序列。[0017]本发明可广泛应用于在其基因组中具有Cullinl基因的功能性直向同源物(即执行相同或相似生物学功能的直向同源物)的所有植物物种。Cullinl直向同源物(即其它物种中的Cullinl基因)的鉴定可以在许多作物中进行,所述鉴定方法是本领域已知的。本发明可以例如应用于属于选自以下物种的植物:黄瓜、甜瓜、西萌芦、西瓜、茄子、番茄、辣椒、甘蓝、胡萝卜、菊苣、苦苣、韭葱、莴苣、萝卜、菠菜和甜菜。[0018]因此,本发明涉及经修饰的Cullinl基因,其包含SEQIDNo:1、SEQIDNo:2、SEQIDNo:3、SEQIDNo:4、SEQIDNo:5、SEQIDNo:6、SEQIDNo:7、SEQIDNo:8、SEQIDNo:9、SEQIDN〇:10、SEQIDNo:ll、SEQIDNo:12、SEQIDN0:13、SEQIDN0:14、SEQIDNO:15、SEQIDNO:16、SEQIDNO:17的野生型Cullinl核苷酸序列中的修饰,所述修饰分别导致SEQIDNo:18、SEQIDNo:19、SEQIDN〇:20、SEQIDNo:21、SEQIDNo:22、SEQIDNo:23、SEQIDNo:24、SEQIDNo:25、SEQIDNo:26、SEQIDNo:27、SEQIDNo:28、SEQIDN0:29、SEQIDN0:30、SEQIDN0:31、SEQIDN0:32、SEQIDN0.33、SEQIDN0:34的野生型Cullinl氨基酸序列中的修饰。[0019]图1-17分别显示黄瓜、甜瓜、西萌芦、西瓜、茄子、番茄、辣椒、甘蓝、胡萝卜、芹菜、菊苣、苦苣、韭葱、莴苣、萝卜、菠菜和甜菜的野生型Cullinl核苷酸序列SEQIDNO.1-17。图18-34分别显示黄瓜、甜瓜、西萌芦、西瓜、茄子、番茄、辣椒、甘蓝、胡萝卜、芹菜、菊苣、苦苣、韭葱、莴苣、萝卜、菠菜和甜菜的野生型Cullinl氨基酸序列SEQIDNO.18-34。[0020]如本文中所用,术语“野生型”通常是指与突变或修饰形式相反,如同其自然界中存在的生物体、基因、蛋白质或性状的形式。在本申请中,野生型特指Cullinl基因的天然存在形式,Cullinl的核苷酸序列的天然存在形式以及Cullinl氨基酸序列的天然存在形式。图1-17和图18-34中分别显示了几种作物的Cullinl基因和Cullinl蛋白的天然形式。[0021]如本文中所用,术语“突变体”、“突变”、“修饰”、“经修饰的”、“突变的Cullinl基因”和“修饰的Cullinl基因”是指对其野生型Cullinl基因的核苷酸改变和氨基酸改变,所述核苷酸改变和氨基酸改变导致野生型基因的经修饰的形式。该修饰可以是任何修饰,包括但不限于SNP。[0022]经修饰的Cu11iη1基因在本文中也称为“本发明的基因”、“经修饰的Cu11in1基因”或“本发明的经修饰的Cullinl基因”。这些术语在本文中可互换使用。如本文中所用,短语“经修饰的Cullinl基因”旨在包含具有导致所述紧凑生长表型的任何修饰的Cullinl基因。[0023]术语“紧凑基因表型”、“紧凑表型”或“紧凑生长表型”在本文中可互换使用,并且指较短的节间长度和或较小的叶面积的表型。包含经修饰的CulIini基因并具有节间的作物,诸如例如黄瓜,可显示较短的节间或较小的叶面积。它们还可显示较短的节间和较小的叶面积。包含该经修饰的Cullinl基因但不具有节间的作物诸如例如莴苣可显示较小的叶面积。[0024]如本文中所用,术语“较小的叶面积”是显示由于本发明的经修饰基因的纯合或杂合存在而导致个体叶面积减小至少10%、至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%按照递增的优先顺序)的叶面积。为了研究本发明的基因对较小的叶面积的影响,本领域技术人员将必须将纯合地或杂合地具有本发明的基因的植物与对于前面提及的植物是同基因的但不具有本发明的基因的植物相比较。[0025]术语“叶”意指由叶柄和叶片组成的植物部分。术语“叶面积”意指由叶片组成的植物部分的表面。[0026]如本文中所用,术语“较短的节间”或“较短的节间长度”是具有由于本发明基因的纯合或杂合存在而导致的个体长度减小至少10%、至少20%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%按照递增的优先顺序)的节间长度。为了研究本发明的基因对较短的节间长度的影响,本领域技术人员将必须将纯合地或杂合地具有本发明的基因的植物与对于前面提及的植物是同基因的但不具有本发明的基因的植物相比较。[0027]导致经修饰的Cu11in1基因的修饰可选自改变Cu11in1基因的mRNA水平的修饰、改变Cu11iη1蛋白结构和或水平的修饰和或改变Cu11iη1蛋白活性的修饰。[0028]本发明的一个方面涉及经修饰的Cullinl基因,其与其野生型基因组序列相比而言包含突变,该突变导致Cullinl蛋白和或蛋白质活性的改变,其中所述经修饰的Cullinl基因能够引起紧凑生长表型。[0029]在一个实施方案中,所述突变是单核苷酸多态性SNP。[0030]在本发明的一个实施方案中,氨基酸序列的所述变化是取代。[0031]在本发明的一个优选实施方案中,所述氨基酸序列的变化存在于Cullinl蛋白的部分内位置30-60处的氨基酸之间,优选SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置40-55处的氨基酸之间的部分或在与其相对应的部分中。[0032]在本发明的一个进一步优选的实施方案中,所述氨基酸序列的变化存在于结合SKPl和或ETA2的Cullinl蛋白的部分中。[0033]优选地,氨基酸取代在Cullinl蛋白中的物理位置位于其中Cullinl蛋白与SKPl和或ETA2结合的蛋白质区域中。Cullinl蛋白与SKPURBX1和F-box蛋白一起形成所谓的SCF复合物,其具有重要的功能性,诸如在叶发育中的作用。根据一些理论,ETA2是维持SCF复合物活性所需的,最有可能地通过促进SCF复合体的组装和解装配循环来实现。[0034]在一个具体的实施方案中,所述经修饰的Cullinl基因包括在黄瓜的SEQIDNO.1的位置147处或在其它作物的Cullinl基因中与其对应的位置处包含SNP的Cullinl基因,其中所述修饰包括在该位置处的核苷酸的变化,并且其中所述修饰导致在黄瓜的野生型蛋白质序列SEQIDNO:18的位置49处或在其它作物中与其对应的位置处的Cullinl蛋白的氨基酸置换。在黄瓜中,变化是从A到G以及从异亮氨酸到甲硫氨酸。在其它作物中,核苷酸和氨基酸的变化可以不同。[0035]在本发明的一个优选实施方案中,核苷酸序列的修饰包括从腺嘌呤、胞嘧啶或胸腺嘧啶至鸟嘌呤的变化。[0036]如本文中所用,定义“编码序列”是由编码该蛋白质的外显子组成的基因DNA的部分。[0037]在本发明的另外一个实施方案中,氨基酸序列中的修饰是在SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置49处,或者在除黄瓜外的作物的情况下,在对应于SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置49的位置处的取代。[0038]发现由本发明的突变引起的氨基酸取代存在于SEQIDN0:18的黄瓜氨基酸序列的位置49处,或者在除黄瓜外的作物的情况下,存在于对应于黄瓜的野生型氨基酸序列SEQIDNO:18的位置49的位置处。该核苷酸突变被认为是非保守的,该氨基酸的变化可以被认为是非保守的。[0039]当编码DNA序列中的一个或多个碱基对的突变导致编码不同氨基酸的改变的密码子三联体时,蛋白质中的氨基酸变化发生。由于遗传密码的冗余性,并非编码DNA序列中的所有点突变都会导致氨基酸变化。编码序列中不导致氨基酸改变的突变称为“沉默突变”。其它突变称为“保守突变”,它们导致一个氨基酸被具有可比性质的另一氨基酸取代,使得突变不可能改变成熟蛋白的折叠或影响其功能。如本文中所用,“非保守氨基酸改变”是指一个氨基酸被具有不同化学性质的另一氨基酸替换,这种不同化学性质可导致编码的蛋白质的稳定性降低,功能改变和或结构效应改变。[0040]在本发明的另外的优选实施方案中,氨基酸序列中的修饰是取代并且由从异亮氨酸至甲硫氨酸的改变组成。[0041]本发明还涉及包含所述经修饰的Cullinl基因的植物。[0042]包含具有SEQIDNo:35的核苷酸序列的所述经修饰的Cullinl基因的黄瓜植物不是本发明的一部分,因此在此放弃。[0043]与不包含所述经修饰的Cullinl基因的相同物种的同基因植物相比,包含该经修饰的Cullinl基因的植物显示紧凑生长表型,即包含较短的节间长度和或较小的叶面积。例如,包含所述经修饰的CulIin1基因的黄瓜植物、甜瓜植物、西萌芦植物、西瓜植物、茄子植物、番茄植物和辣椒植物显示较短的节间长度和或较小的叶面积。这些植物因此特别适合用于高效栽培。包含所述经修饰Cullinl基因的菊苣植物、苦苣植物、莴苣植物、甘蓝植物和菠菜植物显示例如较小的叶面积。因此,这些植物收获用于消费的部分的尺寸较小。因此这些植物特别适合于其中需要较小部分的情况。包含所述经修饰的Cullinl基因的胡萝卜显示较短的节间长度和或较小的叶面积。因此,该植物包含较小的叶片,所述叶片在产品被销售和或消费之前需要被除去。包含所述经修饰的Cullinl基因的辣椒植物显示较短的节间长度和或较小的叶面积。因此,该植物具有更紧凑尺寸,适合于其中需要较小部分和或包含较少的在产品销售和或消费之前需要去除的叶子的情况。包含所述经修饰的CulIini基因的韭葱植物显示出较小的叶面积。因此,不被消费的叶子在产品销售和或消费之前不需要被去除。包含所述经修饰的Cullinl基因的萝卜植物和甜菜植物显示较小的叶面积。因此,在产品销售和或消费之前需要去除较少的叶子。[0044]纯合或杂合地包含所述经修饰的Cullinl基因的本发明植物可以是自交系、杂种、双单倍体的植物或分离群体植物的植物。[0045]本发明的植物可具有处于杂合状态的所述经修饰的Cullinl基因,因为这样的植物显示中等水平的性状。此外,这种植物可以是该基因的潜在来源,当与任选地也纯合或杂合地具有所述经修饰的基因的另一植物杂交时,可得到纯合或杂合地具有该经修饰的基因并且显示具有紧凑生长表型的性状的后代植物。[0046]本发明还涉及通过使用包含该经修饰的Cullinl基因的种子生长所述植物来产生具有该经修饰的Cullinl基因的植物的方法,所述经修饰的Cullinl基因导致紧凑生长表型。[0047]本发明还涉及通过使用在其基因组中携带所述经修饰的Cullinl基因的植物材料的组织培养产生具有该经修饰的Cu11iη1基因的植物的方法。[0048]本发明还涉及通过使用在其基因组中携带该经修饰的Cullinl基因的植物材料的营养繁殖来产生具有该经修饰的Cullinl基因的植物的方法,所述经修饰的Cullinl基因导致紧凑生长表型。[0049]本发明还提供了通过使用加倍单倍体生成技术从包含该经修饰的Cullinl基因的黄瓜植物生成加倍单倍体系,来产生具有该经修饰的Cullinl基因的植物的方法。[0050]本发明还涉及包含本发明的经修饰的Cullinl基因的植物种子,其中可从该种子生长的植物显示紧凑生长表型。[0051]本发明还涉及用于种子产生的方法,其包括从本发明的种子生长植物,通过允许授粉发生而允许植物产生种子,并且收获那些种子。种子的产生适宜地通过杂交或自交进行。以该方式产生的种子导致其生长的植物的紧凑生长表型。[0052]本发明还涉及杂交种子和产生这种杂交种子的方法,其包括将第一亲本植物与第二亲本植物杂交并收获所得的杂交种子,其中所述第一亲本植物和或所述第二亲本植物具有本发明的经修饰的Cullinl基因。通过生长包含本发明的经修饰的Cullinl基因的所得种子而产生的显示本发明的紧凑生长表型的杂交植物也是本发明的植物。[0053]本发明的另一方面涉及能够发育成和或源自包含经修饰的Cullinl基因的植物的繁殖材料,其中与不包含经修饰的Cullinl基因的相同物种的同基因植物相比,所述植物显示紧凑生长表型,其中繁殖材料包含本发明的经修饰的CulIini基因,并且其中繁殖材料选自小孢子、花粉、子房、胚珠、胚、胚囊、卵细胞、插条、根、下胚轴、子叶、茎、叶、花、花药、种子、分生细胞、原生质体和细胞或其组织培养物。[0054]因此本发明还涉及适合有性繁殖的要求保护的植物的部分。此类部分例如选自小孢子、花粉、子房、胚珠、胚囊和卵细胞。另外,本发明涉及要求保护的植物的适合于营养繁殖的部分,其特别地是插条、根、茎、细胞、原生质体。如上所述的植物部分被认为是繁殖材料。从繁殖材料产生的植物包含所述经修饰的Cullinl基因,其导致紧凑生长表型,从而使得能够进行高效栽培和或适于产生需要较小产品的销售部分。[0055]根据其另一方面,本发明提供了携带本发明的经修饰的Cullinl基因的植物的组织培养物,其也是繁殖材料。组织培养物包含可再生细胞。可以从植物的任何部分,特别是从叶、花粉、胚、子叶、下胚轴、分生细胞、根、根尖、花药、花、种子和茎中选择或衍生此类组织培养物。组织培养物可被再生成携带本发明的经修饰的Cullinl基因的植物,所述再生植物表达本发明的性状并且也是本发明的一部分。[0056]本发明还涉及所述经修饰的Cullinl基因用于开发显示紧凑生长表型的植物的用途。技术人员熟悉将新性状引入已经具有其它所需农业特性的植物中,例如通过基因渗入。可通过标准育种技术进行渗入,其中可通过表型或使用标记或其组合进行选择。[0057]本发明还涉及该经修饰的Cullinl基因或其包含所述修饰的部分作为鉴定显示紧凑生长表型的植物的标记的用途。[0058]如本申请中所用的“用于鉴定”或“用于鉴定的方法”包括Cullinl基因中描述的因果)SNP作为标记的用途。本发明还涉及可基于Cullinl基因中的修饰包括因果SNP进行开发的其它标记,以及可基于CulIinl基因的野生型序列进行开发的其它标记。[0059]本发明还涉及SEQIDNO.35-51的任何序列或其部分用作用于鉴定显示紧凑生长表型(即包含较短的节间长度和或较小的叶面积)的植物的标记的用途。如果使用这些序列中的任一序列的一部分,则该部分必须包含所述修饰。例如,SEQIDNo.35或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的黄瓜植物;SEQIDNo.36或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的甜瓜植物;SEQIDNo.37或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的西萌芦植物;SEQIDNo.38或其部分可以用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的西瓜植物;SEQIDNo.39或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的茄子植物;SEQIDNo.40或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的番茄植物;SEQIDNo.41或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的辣椒植物;SEQIDNo.42或其部分可用于鉴定显示较小的叶面积的甘蓝植株;SEQIDNo.43或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的胡萝卜属植物;SEQIDNo.44或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的芹菜植物;SEQIDNo.45或其部分可用于鉴定显示较小叶面积的菊苣植物;SEQIDNo.46或其部分可用于鉴定显示较小叶面积的苦苣植物;SEQIDNo.47或其部分可用于鉴定显示较小叶面积的韭葱植物;SEQIDNo.48或其部分可用于鉴定显示较小叶面积的莴苣植物;SEQIDNo.49或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小的叶面积的萝卜植物;SEQIDNo.50或其部分可用于鉴定显示较小叶面积的菠菜植物;SEQIDNo.51或其部分可用于鉴定显示较短的节间长度和或较小叶面积的甜菜植物。本发明还涉及源自SEQIDNo.1-17或SEQIDNo.36-51的任何标记用于鉴定显示紧凑生长表型的植物用途。任何此类衍生标记必须包含导致本发明的表型的所述修饰。[0060]一般地,为了鉴定显示紧凑生长表型的植物,在Cullinl基因中确定在位置147处或与其对应的位置处是否存在A、C或TSEQIDNo.1-17或GSEQIDNo.35-51。[0061]本发明还涉及用于获得显示紧凑生长表型的植物的方法,其包括:[0062]a使包含本发明的经修饰的Cu11in1基因的植物与不包含所述经修饰的Cu11in1基因的植物杂交以获得Fl群体;[0063]b任选地将来自Fl的植物进行一轮或多轮自交和或杂交以获得下一代群体;和[0064]c选择具有紧凑生长表型和本发明的经修饰的Cullinl基因的植物。[0065]本发明还涉及获得显示紧凑生长表型的植物的方法,该方法包括:[0066]a将包含本发明的经修饰的Cu11in1基因的植物与包含所述经修饰的Cu11in1基因的另一植物杂交以获得Fl群体;[0067]b任选地将来自Fl的植物进行一轮或多轮自交和或杂交以获得下一代群体;和[0068]c选择具有紧凑生长表型和本发明的经修饰的Cullinl基因的植物。[0069]本发明还涉及用于鉴定显示紧凑生长表型,包含所述经修饰的Cullinl的植物或其包含所述修饰的部分的标记。优选地,所述修饰是在黄瓜的SEQIDNO:1的位置147处或其附近,或者在除黄瓜外的作物的情况下是在对应于黄瓜的SEQIDNO:1的位置147的位置处或其附近的核苷酸取代,所述修饰导致Cullinl蛋白质中的氨基酸取代。[0070]本发明还涉及用于从植物群体中选择显示紧凑生长表型的植物的方法,其包括在植物群体的植物的基因组中检测SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147处,或者对于除黄瓜外的作物而言在对应于SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147的位置处是否存在鸟嘌呤,以及选择在SEQIDNO:1的位置147处包含鸟嘌呤(如SEQIDNO.35中显示的)、或者对于除黄瓜外的作物而言在对应于SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147的位置处包含鸟嘌呤如SEQIDNO.36-51中显示的)的植物。[0071]附图[0072]图1.野生型黄瓜Cullinl编码序列,SEQIDNO.1。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“A”。[0073]图2.野生型甜瓜Cullinl编码序列,SEQIDNO.2。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“A”。[0074]图3.野生型笋瓜(squashCullinl编码序列,SEQIDNO.3。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147个核苷酸。如此处所示,野生型核苷酸是“A”。[0075]图4.野生型西瓜Cullinl编码序列,SEQIDNO.4。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“A”。[0076]图5.野生型茄子Cullinl编码序列,SEQIDNO.5。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“T”。[0077]图6.野生型番茄Cullinl编码序列,SEQIDNO.6。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“T”。[0078]图7.野生型辣椒Cullinl编码序列,SEQIDNO.7。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“T”。[0079]图8.野生型圆白菜Cullinl编码序列,SEQIDNO.8。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始138个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0080]图9.野生型胡萝卜Cullinl编码序列,SEQIDNO.9。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始144个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0081]图10.野生型芹菜Cullinl编码序列,SEQIDNO.10。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0082]图11.野生型菊苣Cullinl编码序列,SEQIDNO.11。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0083]图12.野生型玉兰菜endiveCullinl编码序列,SEQIDNO.12。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0084]图13.野生型韭葱(IeekCullinl编码序列,SEQIDNO.13。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147个核苷酸。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0085]图14.野生型莴苣Cullinl编码序列,SEQIDNO.14。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0086]图15.野生型萝卜Cullinl编码序列,SEQIDNO.15。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始138个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“C”。[0087]图16.野生型菠菜Cullinl编码序列,SEQIDNO.16。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“A”。[0088]图17.野生型甜菜根Cullinl编码序列,SEQIDNO.17。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141个核苷酸)。如此处所示,野生型核苷酸是“A”。[0089]图18.野生型黄瓜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.18。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0090]图19.野生型甜瓜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.19。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0091]图20.野生型笋瓜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.20。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0092]图21.野生型西瓜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.21。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0093]图22.野生型茄子Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.22。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0094]图23.野生型番茄Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.23。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0095]图24.野生型辣椒Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.24。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0096]图25.野生型圆白菜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.25。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始46个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0097]图26.野生型胡萝卜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.26。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始48个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0098]图27.野生型芹菜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.27。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0099]图28.野生型菊苣Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.28。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0100]图29.野生型玉兰菜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.29。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0101]图30.野生型韭葱Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.30。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0102]图31.野生型莴苣Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.31。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0103]图32.野生型萝卜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.32。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始46个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0104]图33.野生型菠菜Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.33。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0105]图34.野生型甜菜根Cullinl蛋白质序列,SEQIDNO.34。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,野生型氨基酸是“I”。[0106]图35.“经修饰的”黄瓜Cullinl编码序列SEQIDNO.35。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147个氨基酸。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0107]图36.“经修饰的”甜瓜Cullinl编码序列SEQIDNO.36。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0108]图37.“经修饰的”笋瓜Cullinl编码序列SEQIDNO.37。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0109]图38.“经修饰的”西瓜Cullinl编码序列SEQIDNO.38。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0110]图39.“经修饰的”茄子Cullinl编码序列SEQIDNO.39。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0111]图40.“经修饰的”番茄Cullinl编码序列SEQIDNO.40。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0112]图41.“经修饰的”辣椒Cullinl编码序列SEQIDNO.41。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0113]图42.“经修饰的”圆白菜Cullinl编码序列SEQIDNO.42。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始138bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0114]图43.“经修饰的”胡萝卜Cullinl编码序列SEQIDNO.43。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始144bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0115]图44.“经修饰的”芹菜Cullinl编码序列SEQIDNO.44。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0116]图45.“经修饰的”菊苣Cullinl编码序列SEQIDNO.45。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0117]图46.“经修饰的”玉兰菜Cullinl编码序列SEQIDNO.46。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0118]图47.“经修饰的”韭葱Cullinl编码序列SEQIDNO.47。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始147bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0119]图48.“经修饰的”莴苣Cullinl编码序列SEQIDNO.48。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0120]图49.“经修饰的”萝卜Cullinl编码序列SEQIDNO.49。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始138bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0121]图50.“经修饰的”菠菜Cullinl编码序列SEQIDNO.50。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0122]图51.“经修饰的”甜菜根Cullinl编码序列SEQIDNO.51。括号之间并且以粗体显示的核苷酸表示SNP的位置从起始点开始141bp。如此处所示,经修饰的核苷酸是“G”。[0123]图52.“经修饰的”黄瓜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.52。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0124]图53.“经修饰的”甜瓜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.53。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0125]图54.“经修饰的”笋瓜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.54。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0126]图55.“经修饰的”西瓜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.55。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0127]图56.“经修饰的”茄子Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.56。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0128]图57.“经修饰的”番茄Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.57。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0129]图58.“经修饰的”辣椒Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.58。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0130]图59.“经修饰的”圆白菜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.59。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始46个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0131]图60.“经修饰的”胡萝卜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.60。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始48个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0132]图61.“经修饰的”芹菜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.61。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0133]图62.“经修饰的”菊苣Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.62。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0134]图63.“经修饰的”玉兰菜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.63。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0135]图64.“经修饰的”韭葱Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.64。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始49个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0136]图65.“经修饰的”莴苣Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.65。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0137]图66.“经修饰的”萝卜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.66。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始46个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0138]图67.“经修饰的”菠菜Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.67。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0139]图68.“经修饰的”甜菜根Cullinl蛋白质序列SEQIDNO.68。括号之间并且以粗体显示的氨基酸表示由SNP引起的氨基酸变化的位置从起始点开始47个氨基酸)。如此处所示,经修饰的氨基酸是¥。[0140]图69.以下各种作物的Cullinl编码序列直向同源物野生型)的多重序列比对:芸苔(SEQIDN0·8、萝卜(SEQIDN0·15、甜菜(SEQIDN0·17、菠菜(SEQIDN0·16、韭葱SEQIDN0·13、笋瓜(SEQIDN0·3、西瓜(SEQIDN0·4、黄瓜(SEQIDN0·1、甜瓜(SEQIDN0·2、番茄(SEQIDN0·6、茄子(SEQIDN0·5、辣椒(SEQIDN0·7、莴苣(SEQIDN0.14、菊苣(SEQIDN0.11、玉兰菜(SEQIDN0.12、胡萝卜(SEQIDN0.9、芹菜(SEQIDNO.10。括号之间并且以粗体显示了黄瓜编码序列中位置147处以及对于其它作物而言对应于该位置的位置处的SNP。[0141]图70.以下各种作物的Cullinl氨基酸直向同源物野生型)的多重序列比对:甜菜SEQIDN0.34、菠菜(SEQIDN0.33、拟南芥(SEQIDN0.69、芸苔(SEQIDN0.25、萝卜SEQIDN0·32、韭葱(SEQIDN0·30、茄子(SEQIDN0·22、番茄(SEQIDN0·23、辣椒SEQIDN0·24、黄瓜(SEQIDN0·18、甜瓜(SEQIDN0·19、西瓜(SEQIDN0·21、笋瓜SEQIDN0·20、芹菜(SEQIDN0·27、莴苣(SEQIDN0·31、玉兰菜(SEQIDN0·29、菊苣(SEQIDNO.28、胡萝卜SEQIDNO.26。括号之间并且以粗体显示了黄瓜氨基酸序列中位置49处以及对于其它作物而言对应于该位置的位置处的SNP。实施例[0142]实施例1[0143]黄瓜中Cullinl基因修饰的鉴定[0144]将从商购可得的“高线材”黄瓜品种“HiLisa”制成的F2杂交群体用于创建新的遗传图谱。总共使用375个标记和398个F2系。对这些杂交群体进行的QTL分析揭示了第6号染色体上的一个主要QTL,其导致较小的节间长度和较小的叶表面。对QTL的峰标记的测序揭示了存在于标记序列中的SNP。该特定的序列在杂交群体中是多态性的。通过BLAST鉴定了第6号染色体上该主要QTL的核苷酸序列。序列的最佳BLAST命中均与Cullinl基因的序列相似。[0145]实施例2[0146]验证Cullinl基因中的SNP对节间长度和植物叶面积的影响[0147]对具有较短的节间和较小的叶的表型的不同黄瓜植物群体每个群体由不同的商购可得的’高线材’品种制成进行表型和遗传分析。关于表型和遗传数据,参见表1。[0148]播种后3周测量植物。为了估计叶面积,从第二片叶子不是子叶测量所有存在的叶片,并测量叶片的宽度和长度,将其彼此相乘以获得叶面积的(粗略估计的)评分。在表1的第三栏中,给出了Cu11in1基因SNP的不同单倍型。评分A表示SNP标记评分为纯合野生型Curinl基因,B表示纯合的经修饰的CulIinl基因。[0149]在第一群体中,对于经修饰的Cullinl基因纯合的植物⑻显示节间长度平均为对于野生型Cullinl基因评分为纯合的植物A的长度的63%A植物对于经修饰的Cullinl基因是纯合的)显示叶面积平均为A植物(对于野生型Cullinl基因是纯合的)的长度的38%〇[0150]在第二群体中,B植物显示节间长度平均为相同群体的A植物的78%,叶面积为相同群体的A植物的39%。[0151]在第三群体中,与A植物的平均值相比,B植物显示节间长度平均为66%,叶面积平均为47%。[0152]表I[0153]来源于商购可得的高线材品种的3种不同黄瓜品系的表型和基因型分析结果。节间长度被定义为主茎长度除以节间数。通过测量从第二片叶子不是子叶开始的存在于植物中的所有叶子的长度和宽度,将长度与宽度相乘,并计算每株植物的平均值来粗略估计叶面积。对于CullinlSNP评分,评分A表示标记得分为A纯合野生型),B表示纯合的经修饰的。[0154][0155][0156]实施例3[0157]创建具有Cullinl基因突变的甜瓜植物;通过甲磺酸乙酯ems对植物进行遗传修饰,并鉴定具有突变的CulIinl基因的植物[0158]通过在室温下24小时期间将约5000粒种子浸入0.07%wvEMS的充气溶液中,用EMS处理甜瓜种子。将经处理的种子在小塑料容器中于纸上萌发,并将所得植物在温室中生长并自花授粉以产生种子。成熟后,收获这些种子并合并成一个库。所得种子库用作起始材料以鉴定显示较小的节间长度和或较小的叶面积的单个植物。[0159]将获得的Cullinl突变体在温室中生长,以通过自体受精产生品系。分析甜瓜植物品系以确认较小的节间长度和较小的叶面积。当品系就较小的节间长度和或较小的叶面积发生分离时,选择植物并在进行另外一轮Cullinl品系近交后选择植物。通过其与对照系相比的较短节间和或较小叶面积来鉴定CulIini突变体。[0160]实施例4[0161]鉴定包含Cullinl基因的作物[0162]使用基本局部比对搜索工具BLAST程序将如SEQIDNO:1中鉴定的Cullinl基因和如SEQIDNO:18中鉴定的蛋白质序列与其它作物植物的核苷酸编码序列和蛋白质序列进行比较。这导致其它植物中候选Cullinl直向同源基因的鉴定。Cullinl编码序列的多重序列比对证实了这些是直向同源Cullinl基因,参见图69。蛋白质序列的多重序列比对证实这些是直向同源Cullinl蛋白质,参见图70。

权利要求:1.一种经修饰的Cullinl基因,其在SEQIDNo:l:、SEQIDNo:2、SEQIDNo:3、SEQIDNo:4、SEQIDNo:5、SEQIDNo:6、SEQIDNo:7、SEQIDNo:8、SEQIDNo:9、SEQIDNo:10、SEQIDNo:ll、SEQIDNo:12、SEQIDN0:13、SEQIDN0:14、SEQIDN0:15、SEQIDNO:16、SEQIDNO:17的野生型Cullinl核苷酸序列中包含修饰,所述修饰分别导致SEQIDNo:18、SEQIDNo:19、SEQIDN〇:20、SEQIDNo:21、SEQIDNo:22、SEQIDNo:23、SEQIDNo:24、SEQIDNo:25、SEQIDNo:26、SEQIDNo:27、SEQIDNo:28、SEQIDN0:29、SEQIDN0:30、SEQIDN0:31、SEQIDN0:32、SEQIDN0.33、SEQIDN0:34的野生型Cullinl氨基酸序列内的变化。2.根据权利要求1所述的经修饰的Cullinl基因,其中所述核苷酸序列的修饰是导致Cullinl蛋白的氨基酸序列内的变化的位置处的SNP。3.根据权利要求1或2所述的经修饰的Cullinl基因,其中所述氨基酸序列的变化是取代。4.根据权利要求1-3中任一项所述的经修饰的Cullinl基因,其中所述氨基酸序列的所述变化存在于SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置30-60处的氨基酸之间的Cullinl蛋白质部分中,优选在SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置40-55处的氨基酸之间的部分中,或对于其它作物在与其相对应的位置处。5.根据权利要求1-4中任一项所述的经修饰的Cullinl基因,其中所述氨基酸序列的所述修饰存在于结合SKPl和或ETA-2的Cullinl蛋白的部分中。6.根据权利要求1-5中任一项所述的经修饰的Cullinl基因,其中所述核苷酸序列的修饰是SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147处,或对于除黄瓜外的作物而言在对应于SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147的位置处的SNP,所述SNP导致SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置49处,或对于除黄瓜外的作物而言对应于SEQIDNO:18的黄瓜氨基酸序列的位置49的位置处的氨基酸变化。7.根据权利要求6所述的经修饰的Cu11in1基因,其中所述SNP包含从腺嘌呤、胞嘧啶或胸腺嘧啶至鸟嘌呤的变化。8.根据权利要求1-7中任一项所述的经修饰的Cullinl基因,其中在黄瓜中,所述SNP包括从腺嘌呤、胞嘧啶或胸腺嘧啶至鸟嘌呤的变化,并且所述氨基酸取代包括从异亮氨酸至甲硫氨酸的变化。9.一种植物,其包含如权利要求1-8中任一项所述的经修饰的Cullinl基因。10.根据权利要求9所述的植物,其中所述植物属于选自由以下的物种:黄瓜Cucumissativus、甜瓜(Cucumismelo、西萌芦(Curcurbitapepo、西瓜(CitrullusIanatus、前子(Solanummelongena,番前(SolanumIycopersicum,辣椒(Capsicumannuum、甘蓝Brassicaoleracea、古月萝卜(Daucuscarota、序菜(Apiumgraveolens、菊苣Cichoriumintybus、苦苣(Cichoriumendivia、韭葱(Alliumampeloprasum、萬苣Lactucasativa、萝卜(Raphanussativus、菠菜(Spinaciaoleracea和甜菜(Betavulgaris〇11.根据权利要求9或10所述的植物,其中与不包含所述Cullinl基因的所述修饰的相同物种的同基因植物相比,所述经修饰的Cullinl基因导致显示紧凑生长表型的植物。12.—种植物种子,其包含如权利要求1-8中任一项所述的经修饰的Cullinl基因。13.根据权利要求12所述的植物种子,其中所述植物种子属于选自以下的物种:黄瓜、甜瓜、西萌芦、西瓜、茄子、番茄、辣椒、甘蓝、胡萝卜、芹菜、菊苣、苦苣、韭葱、莴苣、萝卜、菠菜和甜菜。14.一种繁殖材料,其能够发育成权利要求9-11中任一项所述的植物和或来源于所述植物,其中所述繁殖材料包含如权利要求1-8中任一项所述的经修饰的CulIini基因,并且其中繁殖材料选自小孢子、花粉、子房、胚珠、胚、胚囊、卵细胞、插条、根、下胚轴、子叶、茎、叶、花、花药、种子、分生细胞、原生质体或细胞或其组织培养物。15.根据权利要求1-8中任一项所述的经修饰的Cullinl基因用于开发植物的用途,所述植物与未包含所述经修饰的Cullin1基因的同基因植物相比显示紧凑生长表型。16.根据权利要求1-8中任一项所述的经修饰的Cullinl基因或其部分用于鉴定植物的用途,所述植物与不包含所述经修饰的Cullin1基因的同基因植物相比显示紧凑生长表型。17·SEQIDN0:1-SEQIDN0:17和或SEQIDN0:35-SEQIDN0:51的序列中的任一个序列或其部分或源自其的标记用作标记的用途,所述标记用于鉴定与不包含所述经修饰的Cullin1基因的同基因植物相比显示紧凑生长表型的植物。18.根据权利要求15-17中任一项所述的用途,其中所述植物属于选自以下的物种:黄瓜、甜瓜、西萌芦、西瓜、茄子、番茄、辣椒、甘蓝、胡萝卜、芹菜、菊苣、苦苣、韭葱、莴苣、萝卜、菠菜和甜菜。19.一种用于获得显示紧凑生长表型的植物的方法,其包括:a使包含如权利要求1-8的任一项中所述的经修饰的Cullinl基因的植物与不包含所述经修饰的Cullinl基因的植物杂交以获得Fl群体;b任选地将来自所述Fl的植物进行一轮或多轮自交和或杂交以获得下一代群体;和c选择具有紧凑生长表型和本发明的经修饰的Cullinl基因的植物。20.—种用于获得显示紧凑生长表型的植物的方法,其包括:a将包含本发明的经修饰的CulIin1基因的植物与包含所述经修饰的Cu11in1基因的另一植物杂交以获得Fl群体;b任选地将来自Fl的植物进行一轮或多轮自交和或杂交以获得下一代群体;和c选择具有紧凑生长表型和本发明的经修饰的Cullinl基因的植物。21.根据权利要求19或20所述的方法,其中所述植物属于选自以下的物种:黄瓜、甜瓜、西萌芦、西瓜、茄子、番茄、辣椒、甘蓝、胡萝卜、芹菜、菊苣、苦苣、韭葱、莴苣、萝卜、菠菜和甜菜。22.—种用于鉴定显示紧凑生长表型的植物的标记,其包含如权利要求1-8的任一项中所述的经修饰的Cu11in1基因或其包含所述修饰的部分。23.根据权利要求22所述的标记,其中所述修饰是在黄瓜的SEQIDNO:1的位置147处或其附近,或者在除黄瓜外的作物的情况下是在对应于黄瓜的SEQIDNO:1的位置147的位置处或其附近的核苷酸取代,所述修饰导致Cullinl蛋白中的氨基酸取代。24.—种用于从植物群体中选择显示紧凑生长表型的植物的方法,其包括检测在植物群体的植物的基因组中SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147处,或者对于除黄瓜外的作物而言对应于SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147的位置处是否存在鸟嘌呤,以及选择在SEQIDNO:1的位置147处,或者对于除黄瓜外的作物而言在对应于SEQIDNO:1的黄瓜核苷酸序列的位置147的位置处包含鸟嘌呤的植物。

百度查询: 瑞克斯旺种苗集团公司 经修饰的CULLIN1基因

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