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一种基于DTI序列对GBM患者进行风险分层的方法及系统 

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申请/专利权人:中国科学院深圳先进技术研究院;郑州大学第一附属医院

摘要:本申请涉及影像分析技术领域,特别涉及一种基于DTI序列对GBM患者进行风险分层的方法及系统,该方法包括以下步骤:获取GBM患者的数据集;对数据集进行图像采集,得到磁共振DTI序列;基于数据集,获取转录组测序数据;磁共振DTI序列为磁共振弥散张量成像序列;基于磁共振DTI序列,构建影像组学模型;并基于影像组学模型和转录组测序数据,得到影像组学分析结果;基于转录组数据分析方法,得到交叉通路;基于影像组学模型以及交叉通路,对影像组学特征背后的生物学基础进行解释。本申请利用磁共振弥散张量成像序列对IDH野生型胶质母细胞瘤患者进行风险分层与预后预测,并挖掘影像组学预后特征背后的生物学通路,为临床精准治疗提供重要指导。

主权项:1.一种基于DTI序列对GBM患者进行风险分层的方法,其特征在于,包括:获取GBM患者的数据集;所述GBM患者为胶质母细胞瘤患者;所述数据集包括训练集和测试集;对所述数据集进行图像采集,得到磁共振DTI序列;并基于所述数据集,获取转录组测序数据;所述磁共振DTI序列为磁共振弥散张量成像序列;基于所述磁共振DTI序列,构建影像组学模型;并基于所述影像组学模型和所述转录组测序数据,得到影像组学分析结果;基于所述磁共振DTI序列,构建影像组学模型,包括:对所述磁共振DTI序列进行全自动处理;所述全自动处理包括三个部分:剥离颅骨、校正涡流效应和计算生成轴向扩散率、径向扩散率、平均扩散率和各向异性分数参数图,并对四个参数图像进行标准化处理;所述标准化处理包括:校正原始图像的偏置场失真情况;使用三线性插值法,将所有体素各向同性地重采样为1×1×1mm3;将磁共振成像液体衰减反转恢复序列进行轴向重采样后作为模板,利用交互信息相似性度量分别生成轴向扩散率、径向扩散率、平均扩散、各向异性分数以及磁共振成像液体衰减反转恢复序列的配准图像,分别记为rAD、rRD、rMD、rFA和rFLAIR;采用直方图匹配使灰度分布归一化;在对所述磁共振DTI序列进行全自动处理之后,生成标准化二维肿瘤感兴趣区图像,并将其与相对的rAD、rRD、rMD和rFA进行重合检查,确认四个参数图像及其二维肿瘤感兴趣区图像的可靠性;所述生成标准化二维肿瘤感兴趣区图像,包括:在轴向rFLAIR逐层勾勒二维肿瘤感兴趣区的轮廓,并分别利用rAD、rRD、rMD、和rFA图像进行检验和校准,通过三维模拟生成肿瘤的三维感兴趣体积,得到校准结果;从所述数据集中随机抽出部分患者的rFLAIR图像以重复二维肿瘤感兴趣区描绘过程,产生评估者间测试集;基于所述评估者间测试集以及所述校准结果,得到标准化二维肿瘤感兴趣区图像;采用加权基因共表达网络分析以及基因集富集分析方法,对转录组测序数据进行分析,得到用于揭示影像组学特征生物学含义的交叉通路;基于所述影像组学模型以及所述交叉通路,对影像组学特征背后的生物学基础进行解释;其中,基于所述影像组学模型以及所述交叉通路,对影像组学特征背后的生物学基础进行解释,包括:基于所述影像组学模型以及所述交叉通路,分别从单个影像组学特征的生物学含义、DTI参数的生物学含义两个方面探索影像组学特征的生物学含义,对影像组学特征背后的生物学基础进行解释。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国科学院深圳先进技术研究院 郑州大学第一附属医院 一种基于DTI序列对GBM患者进行风险分层的方法及系统

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