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基于PTEN基因状态筛选胶质瘤生物标记物的方法 

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申请/专利权人:北京理工大学

摘要:本发明提供一种基于PTEN基因状态筛选胶质瘤生物标记物的方法,1获取胶质瘤患者的PTEN基因状态;2将胶质瘤患者分为PTEN‑WT亚组和PTEN‑mutant亚组;3分别对各个亚组的患者筛选亚组特异性的DEGs;4将亚组特异性的DEGs与各个亚组患者生存时间进行拟合,得到亚组特异性的OPR‑DEGs;5构建各个亚组患者的风险评分,观测风险评分与肿瘤的恶性程度的关系,并预测各个亚组患者的生存率;6筛选各个亚组的独立预后的OPR‑DEGs;7筛选潜在的靶向药物。本发明通过多因素COX分析恶性程度高的PTEN突变亚组的独立的最优预后基因,这对于PTEN突变的胶质瘤的诊断,预后预测和治疗提供了进一步的指导意义。

主权项:1.一种基于PTEN基因状态筛选胶质瘤生物标记物的方法,其特征在于,包括以下步骤:1获取胶质瘤患者的PTEN基因状态,所述PTEN基因状态为PTEN基因是否发生突变;2根据胶质瘤患者的PTEN基因状态对所述胶质瘤患者进行分层,将所述胶质瘤患者分为野生型PTEN亚组即PTEN-WT亚组,和突变型PTEN亚组即PTEN-mutant亚组;3分别对所述各个亚组的患者筛选亚组特异性的差异基因即DEGs;4将所述亚组特异性的DEGs与所述各个亚组患者生存时间进行拟合,得到亚组特异性的最优预后DEGs即OPR-DEGs;5利用所述的各个亚组的OPR-DEGs构建所述各个亚组患者的风险评分,观测风险评分与肿瘤的恶性程度的关系,并预测所述各个亚组患者的生存率;6所述的各个亚组的OPR-DEGs筛选各个亚组的独立预后的OPR-DEGs;7对所述的各个亚组的独立预后的OPR-DEGs,筛选潜在的靶向药物。

全文数据:

权利要求:

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