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申请/专利权人：中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心)
摘要：本申请属于生物技术领域，具体涉及一种分析RNA结合蛋白底物的方法，一种捕获与目的RNA结合蛋白RBP互作的RNA的方法，以及一种分析RNA或RBP的方法和文库。本申请不再使用传统紫外光交联，单纯采用CLICK反应进行化学标记与交联，有效排除了结构偏好性，降低了背景结合，具有更高的特异性。
主权项：1.一种捕获与目的RBP互作的RNA的方法，所述方法包括：步骤I：提供细胞样品，将含有目的RBP的质粒转入所述细胞中；步骤II：提供具有炔基的第一试剂，使其与所述细胞接触，以使得所述具有炔基的第一试剂与所述细胞内的RNA形成第一复合物；步骤III：提供具有叠氮-N3，azido基团的第二试剂，使其与所述细胞接触，以使得所述具有叠氮基团的第二试剂与所述细胞内的目的RBP形成第二复合物；步骤IV：在允许铜催化的炔和叠氮环加成反应CUAAC的条件下，所述细胞内的第一复合物和第二复合物接触以形成第三复合物；步骤V：通过对所述第三复合物进行捕获，以实现对与目的RBP互作的RNA的捕获；优选地，所述质粒还含有第一配体例如，生物素；更优选地，在步骤V中，提供第二配体例如，链霉亲和素，通过第一配体与第二配体的结合作用，对所述第三复合物进行捕获，以实现对与目的RBP互作的RNA的捕获。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院北京基因组研究所(国家生物信息中心) 一种分析RNA结合蛋白底物的方法
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