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申请/专利权人:平安科技(深圳)有限公司
摘要:本申请涉及数字医疗技术领域,提供了一种基因表达填充数据的获取方法及装置、存储介质、计算机设备,该方法包括:获取目标细胞样本的第一基因调控网络,并通过预设基因表达量预测模型,得到第一基因表达数据;确定目标细胞样本对应的第一细胞特征,对目标细胞样本进行聚类,得到多个第一细胞类;分别对每个第一细胞类对应的第一基因表达数据进行还原,得到第二基因调控网络,通过所述预设基因表达量预测模型得到第二基因表达数据,并拼接所述第二基因表达数据;计算目标细胞样本的第二细胞特征,并对多个目标细胞样本再次进行聚类,得到第二细胞类,若第一细胞类与第二细胞类一致,则获取拼接后的第二基因表达数据作为基因表达填充数据。
主权项:1.一种基因表达填充数据的获取方法,其特征在于,包括:获取多个训练细胞样本各自对应的第三基因调控网络以及真实基因表达数据,将所述第三基因调控网络输入至初始表达量预测模型的特征识别层中,得到各训练细胞样本对应的第一预测数据特征,并将所述第一预测数据特征输入至所述初始表达量预测模型的全连接层,得到各训练细胞样本对应的第一预测表达数据;基于所述第一预测数据特征、所述第一预测表达数据以及所述真实基因表达数据,计算所述初始表达量预测模型对应的第一模型损失值,包括:基于各训练细胞样本对应的所述第一预测表达数据以及对应的所述真实基因表达数据,通过第一预设损失函数计算所述初始表达量预测模型的第一损失值;获取所述第三基因调控网络对应的第一邻接矩阵,并基于各训练细胞样本对应的所述第一预测数据特征,通过第一预设激活函数确定每个所述训练细胞样本对应的第二邻接矩阵,依据所述第一邻接矩阵、所述第二邻接矩阵以及第二预设损失函数计算所述初始表达量预测模型的第二损失值;依据所述第一损失值以及所述第二损失值,得到所述第一模型损失值;当所述第一模型损失值小于第一预设损失阈值时,得到预设基因表达量预测模型;获取多个目标细胞样本各自对应的第一基因调控网络,并通过预设基因表达量预测模型,得到每个目标细胞样本对应的第一基因表达数据;基于所述第一基因表达数据,确定每个目标细胞样本对应的第一细胞特征,并依据所述第一细胞特征,对所述多个目标细胞样本进行聚类,得到多个第一细胞类;通过预设基因还原网络分别对每个第一细胞类对应的第一基因表达数据进行还原,得到每个第一细胞类中目标细胞样本对应的第二基因调控网络,通过所述预设基因表达量预测模型得到每个第一细胞类中目标细胞样本对应的第二基因表达数据,并拼接所述第二基因表达数据;依据拼接后的第二基因表达数据,计算每个第一细胞类中目标细胞样本的第二细胞特征,并对所述多个目标细胞样本再次进行聚类,得到多个第二细胞类,若所述第一细胞类与所述第二细胞类一致,则获取拼接后的第二基因表达数据作为所述目标细胞样本的基因表达填充数据;其中,所述基于所述第一基因表达数据,确定每个目标细胞样本对应的第一细胞特征包括:通过预设降维模型对每个所述目标细胞样本对应的所述第一基因表达数据进行降维处理,得到第三基因表达数据;基于每个所述目标细胞样本对应的预设维度的第三基因表达数据,计算任意两个所述目标细胞样本之间的目标细胞相似度;将任一目标细胞样本作为目标节点细胞,并依据所述目标节点细胞与其余目标细胞样本之间的目标细胞相似度,将除所述目标节点细胞外的所述目标细胞样本按照所述目标细胞相似度排序,确定相似度较高的预设数量的所述目标细胞样本;将所述目标节点细胞与所述预设数量的所述目标细胞样本之间分别生成细胞关联边,以构建目标细胞图网络,并将所述目标细胞图网络输入至细胞特征识别模型中,得到第一细胞特征。
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