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基因测序方法、装置、设备和计算机可读存储介质 

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申请/专利权人:江苏高美基因科技有限公司

摘要:本申请提供一种基因测序方法、装置、设备和计算机可读存储介质;本申请中基因测序方法,包括:接收基因测序指令,确定所述基因测序指令对应待检测的初始基因样本;按照预设基因裁剪策略对所述初始基因样本进行映射剪切,获得所述初始基因样本对应的基因样本序列;确定所述基因样本序列中的甲基化位点,并对所述甲基化位点进行分析,获得基因测序结果;本申请中按照按预设裁剪策略对初始基因样本进行映射剪切,获得初始基因样本对应的基因样本序列,对基因样本序列中的甲基化位点进行分析,获得基因测序结果,这样的基因测序操作更加便捷,提高了基因样本分析的灵敏度和准确性。

主权项:1.一种基因测序装置,其特征在于,所述基因测序装置包括:获取确定模块,用于接收基因测序指令,确定所述基因测序指令对应待检测的初始基因样本;基因裁剪模块,用于按照预设基因裁剪策略对所述初始基因样本进行映射剪切,获得所述初始基因样本对应的基因样本序列;位点分析模块,用于确定所述基因样本序列中的插入点作为甲基化位点,将所述甲基化位点之间的基因片段作为融合读段;以及用于分析所述融合读段的位置,确定病毒基因片段并将所述病毒基因片段作为所述基因测序结果;其中,所述病毒基因片段在基因样本序列上都有两个插入位点,根据所述融合读段在所述基因样本序列的相对位置确定插入的病毒基因组片段;所述基因裁剪模块用于:按照预设基因裁剪策略和预设基因数据库对所述初始基因样本进行映射剪切,获得所述初始基因样本对应的未读取基因片段;其中,预设裁剪策略是指设定预设宽度和预设步长的窗口进行基因裁剪;所述预设基因数据库中的人类基因序列和病毒基因序列;将所述未读取基因片段进行重组,获得所述初始基因样本对应的基因样本序列。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 江苏高美基因科技有限公司 基因测序方法、装置、设备和计算机可读存储介质

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