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申请/专利权人:杭州链康医学检验实验室有限公司
摘要:本发明公开了一种预测MSI总体状态的标记微卫星位点、系统及试剂盒,属于MSI检测技术领域。本发明通过已知微卫星位点建立回归模型,预测22个标记微卫星位点的稳定性,进一步建立机器学习模型建立MSI总体状态。利用本发明,通过对二代测序数据的分析可在不同NGS检测平台、不同癌种中,无需正常样本配对即可进行MSI总体状态预测,稳定快捷,结果准确,可重复性高,减少了检测的局限性。
主权项:1.标记微卫星位点的检测试剂在制备用于确定待测样本MSI总体状态的试剂盒中的应用,其特征在于,所述标记微卫星位点包括: 位点编号 染色体 位置 重复单元 重复次数 1 chr1 201754410 T 17 2 chr2 39564893 T 28 3 chr2 47641559 A 27 4 chr2 51288511 AC 21 5 chr2 62063093 A 17 6 chr2 95849361 T 23 7 chr2 108479622 T 18 8 chr4 55598211 T 25 9 chr5 112213678 TG 20 10 chr5 172421760 T 15 11 chr6 142691950 T 17 12 chr7 1787519 A 17 13 chr7 74608740 T 13 14 chr11 102193508 A 26 15 chr11 106695514 T 12 16 chr13 31722620 A 17 17 chr14 23652346 A 21 18 chr15 45897771 T 14 19 chr16 18882659 A 15 20 chr17 19314917 T 18 21 chr17 37152123 GT 20 22 chr22 29696468 T 16 。
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百度查询: 杭州链康医学检验实验室有限公司 预测MSI状态的微卫星位点、系统及试剂盒
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