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申请/专利权人:复旦大学附属中山医院
摘要:本发明属于生物医学技术领域,具体公开了早期肺腺癌腺泡状组织学亚型的特征基因集及其筛选方法和应用。本发明使用空间转录组筛选得到腺泡状肺腺癌组织学亚型的特征基因集,该特征基因集包括25个特征基因。本发明筛选出的特征基因集能够有效预测患者的预后,为临床提供新的治疗策略。
主权项:1.早期肺腺癌腺泡状组织学亚型的特征基因集的筛选方法,其特征在于:所述特征基因集包括:S100A6、SSR2、PYCR1、KDELR2、GRB14、MMP15、KDELR3、SMPDL3B、GSTA1、ILF2、MIF、HSP90AA1、COA3、TRIM2、NQO1、SPAG9、NELL1、FGD6、ESRP1、TSPAN6、CAMK1D、PRRC1、IARS2、IGFBP2、IMPA2基因;所述筛选方法包括以下步骤:S1.通过空间转录组学得到差异基因:通过10xGenomicsVisium和DSP两种空间转录组学技术得到腺泡状组织学亚型区域与正常区域的差异基因;差异基因的筛选条件为:FoldChange1.5,padj0.05;S2.将10xGenomicsVisium与DSP筛选到的差异基因取交集,得到腺泡状组织学亚型的特征基因集。
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百度查询: 复旦大学附属中山医院 早期肺腺癌腺泡状组织学亚型的特征基因集及其筛选方法和应用
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