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一种半滑舌鳎性逆转性状关联位点的检测方法 

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摘要:本申请提出了一种半滑舌鳎性逆转性状关联位点的检测方法,通过使用遗传雌性半滑舌鳎群体的性腺组织切片进行表型性别测定,以构建包含表型雄性半滑舌鳎在内的半滑舌鳎样本集;检测各半滑舌鳎样本的基因组序列,以获得SNP基因型数据;以阈模型隐含的连续正态分布的期望作为因变量,以被检验的SNP标记指示变量作为自变量,以与表型关联显著的主成分作为协变量,利用期望最大化算法检验性逆转性状与SNP之间的关联,并确定出与性逆转性状显著关联的QTN位点。本申请的期望最大化算法更直观、更易于编程,进一步的,降低了广义线性模型的求解难度,避免了由权重引起的异常解,同时提高了检测效力。

主权项:1.一种半滑舌鳎性逆转性状关联位点的检测方法,其特征在于,所述检测方法,包括:使用遗传雌性半滑舌鳎群体的性腺组织切片进行表型性别测定,以构建包含表型雄性半滑舌鳎在内的半滑舌鳎样本集;检测各半滑舌鳎样本的基因组序列,以获得SNP基因型数据;以阈模型隐含的连续正态分布的期望作为因变量,以被检验的SNP标记指示变量作为自变量,以与表型关联显著的主成分作为协变量,利用期望最大化算法检验性逆转性状与SNP之间的关联,以确定与性逆转性状显著关联的QTN位点。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国水产科学研究院 一种半滑舌鳎性逆转性状关联位点的检测方法

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