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申请/专利权人：山东大学
摘要：本发明涉及基因数据处理技术领域，公开了多阶段单核苷酸多态性相互作用关联分析方法及系统，方法包括：构建若干个单核苷酸多态性组合；选择一个分类器对第轮待评估的若干个单核苷酸多态性组合进行计算，得到第一次筛选的组合；选择剩余的N‑2个分类器，依次对筛选的组合进行计算，得到每个组合的分数，每个组合均得到N‑2个得分；结合第一个分类器的打分，对每个组合的N‑1个得分进行求和，得到总得分；筛选总得分超过设定阈值的组合，删除总得分低于设定阈值的组合，得到第二次筛选的组合；判断迭代次数是否达到最大重复次数，如果是，就输出筛选的组合。本发明全面评估对疾病影响可能性高的单核苷酸多态性组合，提高系统识别性能。
主权项：1.多阶段单核苷酸多态性相互作用关联分析方法，其特征是，包括：（1）获取患病样本和未患病样本的全基因组单核苷酸多态性组合，对全基因组单核苷酸多态性组合进行预处理；（2）构建第轮待评估的若干个单核苷酸多态性组合；为大于等于1的正整数；的初始值为1；（3）开始第轮迭代，从N个分类器中，随机选择一个分类器对第轮待评估的若干个单核苷酸多态性组合进行计算，得到与疾病相关程度的估计值；按照与疾病相关程度的估计值由高到低的顺序，对组合进行排序，保留排序序号小于设定阈值的组合，对所保留的组合赋予分数，得到第一次筛选的单核苷酸多态性组合；N为大于2的正整数；（4）从剩余的N-1个分类器中，随机筛选出N-2个分类器，使用筛选出的N-2个分类器，对第一次筛选的单核苷酸多态性组合中每个组合进行评估，每个组合均得到N-2个得分；再结合上一步所获得的每个组合的得分，每个组合均得到N-1个得分；对每个组合的N-1个得分进行求和，得到每个组合的总得分；筛选总得分超过设定阈值的组合，删除总得分低于设定阈值的组合，得到第二次筛选的单核苷酸多态性组合；（5）判断迭代次数是否达到最大重复次数，如果是，就输出筛选的单核苷酸多态性组合，如果否，就返回（2）。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 山东大学 多阶段单核苷酸多态性相互作用关联分析方法及系统
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