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一种糙海参SSR标记及其扩增引物、检测方法和应用 

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申请/专利权人:华南农业大学

摘要:本发明公开了一种糙海参SSR标记及其扩增引物、检测方法和应用,属于分子生物学技术领域。本发明利用二代基因组测序获得的糙海参序列,开发获得6个具有高度多态性的糙海参SSR标记,编号分别为HS‑1、HS‑2、HS‑3、HS‑4、HS‑5、HS‑6;其核苷酸序列分别如SEQIDNO.1~6所示。本发明的糙海参SSR标记可用于糙海参遗传多样性分析、亲子鉴定和放流海参溯源,为糙海参遗传多样性研究、种群鉴定和增殖放流奠定基础。

主权项:1.一种评估糙海参遗传多样性的SSR标记的扩增引物,其特征在于,所述的SSR标记包括:HS-1、HS-2、HS-3、HS-4、HS-5和HS-6;所述的HS-1的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示;所述的HS-2的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示;所述的HS-3的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示;所述的HS-4的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示;所述的HS-5的核苷酸序列如SEQIDNO.5所示;所述的HS-6的核苷酸序列如SEQIDNO.6所示;所述的扩增引物包括:针对HS-1位点:F:5'-TGAGCTGAGCCAATGCAGAA-3';R:5'-GATTGCTCCGTGCCCAGT-3';针对HS-2位点:F:5'-CGGCAAAGTTGACAGCATCC-3';R:5'-GCGTCATAGCTCCATGTGGA-3';针对HS-3位点:F:5'-CAAGAGGCGACTAAACGGGA-3';R:5'-TGTCAAGACTTGGCAGGCAT-3';针对HS-4位点:F:5'-TGACTGACTTGTCGACCGAC-3';R:5'-CAGCCGTGAGCCCTCAATTA-3';针对HS-5位点:F:5'-GCGGCAGGCATTTACATGTT-3';R:5'-TTTCAGGGTGGGCCAAATGT-3';针对HS-6位点:F:5'-AAGCCAGTGAGTCACGACTG-3';R:5'-CGGTCCAAGACACGATGACA-3'。

全文数据:

权利要求:

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