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一种基于多组学动态ctDNA监测食管鳞状细胞癌疗效的方法 

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申请/专利权人:天津大学

摘要:本发明公开一种基于多组学动态ctDNA监测食管鳞状细胞癌疗效的方法,包括步骤:S1、对ctDNA靶向测序数据和cfMeDIP‑seq数据进行分析;S2、WGBS差异甲基化区域鉴定;S3、TCGA450K甲基化芯片差异甲基化探针鉴定;S4、cfMeDIP‑seq差异甲基化区域鉴定;S5、甲基化风险评分;S6、定义甲基化免疫指数作为评价指标,用于评价新辅助免疫治疗的预后;S7、利用LogisticRegression方法,构建多组学混合模型,从而得到模型风险打分。本发明整合多个时间点的基因组学和表观遗传学的动态特征,构建机器学习模型,预测食管鳞状细胞癌新辅助免疫治疗的反应,及评估食管癌预后的引物、探针组合及分类模型。

主权项:1.一种基于多组学动态ctDNA监测食管鳞状细胞癌疗效的方法,其特征在于,包括步骤:S1、对ctDNA靶向测序数据和cfMeDIP-seq数据进行分析;S2、WGBS差异甲基化区域鉴定;S3、TCGA450K甲基化芯片差异甲基化探针鉴定;S4、cfMeDIP-seq差异甲基化区域鉴定;S5、甲基化风险评分;S6、定义甲基化免疫指数作为评价指标,用于评价新辅助免疫治疗的预后;S7、利用LogisticRegression方法,构建多组学混合模型,从而得到模型风险打分。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 天津大学 一种基于多组学动态ctDNA监测食管鳞状细胞癌疗效的方法

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