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用于从细胞游离DNA推断基因表达和起源组织的系统和方法 

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摘要:提供了通过推断非侵入性地确定目标基因表达的方法及其在疾病分类和治疗分层中的应用。所公开的方法涉及细胞游离DNA的片段长度多样性的评估,如确定启动子片段熵PFE。片段长度多样性评分可以与核小体缺失区域深度相结合,以产生指示基因表达的度量。在一些实施例中,方法仅使用非侵入性的抽血,并鉴定哪些患者将从免疫检查点抑制中获得持久的临床益处、癌症亚型分类是什么和或肿瘤负荷是什么。在实施例中,方法进一步包括基于分析为个体选择治疗方案。还公开了用于富集来自转录起始位点附近区域的细胞游离DNA的诱饵集。

主权项:1.一种诱饵集,其包含:多个探针,其被配置为从表1或表2中的基因组区域的至少5%富集细胞游离DNA分子。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 小利兰·斯坦福大学托管委员会 用于从细胞游离DNA推断基因表达和起源组织的系统和方法

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