买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！

申请/专利权人：吉林大学

摘要：本发明属于生物特征识别技术领域，涉及一种基于异质节点关系鉴定稻瘟病菌感染水稻致病因子的方法，该方法首先通过深度随机游走模型遍历单一组学互作网络，随机获取顶点固定步长内的节点，通过节点在其同质网络内的权重以及边的权重，构建出顶点的局部特征。随后，将不同网络中的节点进行连接，得到两异质节点间的关系链路特征，接着，通过基于卷积特征提取的DBSCAN聚类算法将具有相似性特征的链路整合到一个簇中，挖掘异构网络集成的潜在关系，之后结合链路预测结果和单一组学互作用网络权重指标，筛选出稻瘟病菌侵染水稻过程中的关键致病因子和抗病因子，具有鉴定结果准确、鉴定速度快等优势。

主权项：1.一种基于异质节点关系鉴定稻瘟病菌感染水稻致病因子的方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤S1.根据水稻与稻瘟病菌互作过程中的基因组、转录组、蛋白质组数据，构建单组学互作用网络，所述单组学互作用网络包括稻瘟病菌-水稻基因组互作用网络、稻瘟病菌-水稻转录组互作用网络、稻瘟病菌-水稻蛋白质互作用网络；步骤S2.采用深度随机游走法获取单组学互作用网络中每个节点的邻居节点集，得到稻瘟病菌-水稻基因组互作用网络、稻瘟病菌-水稻转录组互作用网络与稻瘟病菌-水稻蛋白质互作用网络中各节点的同质局部网络及节点在相应网络中的局部结构；步骤S3.根据同质局部网络中局部结构的节点权重和边的权重构造节点在同质局部网络中的局部特征： ；式中，node1代表头节点，表示节点的权重，表示前一个节点到后一个节点的边的权重；步骤S4.关联稻瘟病菌-水稻基因组互作用网络与稻瘟病菌-水稻转录组互作用网络、稻瘟病菌-水稻基因组互作用网络与稻瘟病菌-水稻蛋白质互作用网络、稻瘟病菌-水稻转录组互作用网络与稻瘟病菌-水稻蛋白质互作用网络，以关联的两个节点作为头节点，计算关联的两个节点对应同质局部网络中的局部特征，拼接两个局部特征，得到属于关联的两个节点的异质节点局部关系链路特征；步骤S5.对获得的异质节点局部关系链路特征进行分类，赋予一个“类”标签“1”或“0”，“1”表示异质节点间存在链路关系，为一种明确的关系；“0”表示一种未知待预测的关系；步骤S6.基于改进的DBSCAN算法预测未知的异质节点间的潜在链路；步骤S6.1.利用卷积模块从高维异质节点局部关系链路特征数据中提取特征，实现降维的同时保留链路特征异质性信息；步骤S6.2.利用DBSCAN算法对卷积模块提取的特征进行处理，将具有相似性特征的链路整合到一个簇中，并将聚类结果中含有标签为“1”的簇作为有效结果簇，根据有效结果簇预测异质节点间的潜在链路，构建多源异质网络；步骤S7.根据节点在单组学互作用网络中的权重，对所有节点进行排序，选取权重值排在前50%的生物分子；步骤S8.将步骤S6与步骤S7的筛选结果取交集，得到关键因子，所述关键因子包含稻瘟病菌产生的关键致病因子和水稻的抗病性因子。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 吉林大学 基于异质节点关系鉴定稻瘟病菌感染水稻致病因子的方法