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申请/专利权人：广东医科大学
摘要：本发明涉及生物信息学领域，具体公开了一种基于蛋白互作网络的KEGG通路新基因预测方法；本发明以蛋白－蛋白互作网络为基础，查询目标基因的互作基因，然后将互作基因注释到目标通路的节点并识别出这些节点的邻居节点，计算目标基因与邻居基因的功能相似性指标，再通过统计推断方法判断目标基因是否注释到目标通路，以此通过预测注释到KEGG通路节点中的新基因来扩充现有的通路，有助于进一步从通路角度解析疾病的发生发展机制。
主权项：1.一种基于蛋白互作网络的KEGG通路新基因预测方法，其特征在于，具体包括以下步骤：S1、基于蛋白互作网络识别与目标基因存在直接互作的邻居基因；S2、将互作邻居基因映射到KEGG数据库中，查找互作邻居基因注释到的目标通路节点，并识别出与目标通路节点相连接的邻居节点；S3、计算目标基因与邻居节点的功能相似性度量值，并基于permutation方法计算相似性度量值的统计显著性，判别目标基因是否注释到目标通路的节点上。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 广东医科大学 一种基于蛋白互作网络的KEGG通路新基因预测方法
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