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抗体序列的获取与抗体设计模型的训练方法、装置 

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申请/专利权人:北京百度网讯科技有限公司

摘要:本公开提供一种抗体序列的获取与抗体设计模型的训练方法。获取方法包括:根据抗原MSA序列与抗体MSA序列的拼接序列、抗原MSA序列与抗体MSA序列,得到不同序列位置处的氨基酸的第一特征;根据参考抗原抗体复合体所构建的图Graph,得到不同三维坐标处的氨基酸的第二特征;将不同序列位置处的氨基酸的第一特征与对应不同序列位置的三维坐标处的氨基酸的第二特征融合,根据融合特征得到每个氨基酸在不同位置处的概率信息;根据氨基酸与氨基酸在同位置处的概率信息得到目标抗体序列。训练方法包括:获取多个数据样本;构建包含第一特征提取模块、第二特征提取模块与特征融合模块的神经网络模型;使用多个数据样本对神经网络模型进行训练,得到抗体设计模型。

主权项:1.一种抗体序列的获取方法,包括:分别对抗原序列与初始抗体序列进行多序列比对MSA,得到抗原MSA序列与抗体MSA序列;将所述抗原MSA序列与所述抗体MSA序列进行拼接,根据拼接序列、所述抗原MSA序列与所述抗体MSA序列中各氨基酸的属性特征,得到所述拼接序列中不同序列位置处的氨基酸的第一特征;根据参考抗原抗体复合体中的氨基酸与氨基酸之间的连接关系构建图Graph,根据所述Graph中各氨基酸的属性特征,得到所述参考抗原抗体复合体中不同三维坐标处的氨基酸的第二特征;将不同序列位置处的氨基酸的第一特征与对应不同序列位置的三维坐标处的氨基酸的第二特征进行融合,根据融合特征得到每个氨基酸在抗体序列中不同位置处的概率信息;根据氨基酸以及氨基酸在抗体序列中不同位置处的概率信息,得到目标抗体序列。

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