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申请/专利权人：先正达农作物保护股份公司
摘要：本发明涉及一种用于鉴定田地或温室中包含变体的植物病原体群体的方法，该方法包括：a在包含有害植物病原生物体的至少一部分的位置收集一组样品；b处理该样品组；并且通过全宏基因组序列分析来分析每个样品，从而产生全宏基因组读段；c对该有害生物体的DNA和或RNA进行测序，并确定一个或多个DNA和或RNA序列；d任选地，使这些全宏基因组读段经受包括去除非植物病原体读段在内的质量控制程序；e通过将剩余读段分解成一组样品来源的约300个碱基对的k‑mer，将这些读段与来自已知真菌的一个或多个k‑mer阵列进行比较；以及f分析这些k‑mer模式读段表以根据与已知真菌亚型或具有已知结果或分类学组成的其他生物样品的比较k‑mer分析来确定生物样品；以及g将关于所确定的植物病原体群体的抗性的信息输入到抗性热图和或抗性预测模块中，该信息包括在该样品中确定的每个单独品种以及每个单独品种的出现。
主权项：1.一种用于鉴定田地或温室中包含变体的植物病原体群体的方法，所述方法包括：a在包含有害植物病原生物体的至少一部分的位置收集一组样品；b处理所述样品组；并且通过全宏基因组序列分析来分析每个样品，从而产生全宏基因组读段；c对所述有害生物体的DNA和或RNA进行测序，并确定一个或多个DNA和或RNA序列；d任选地，使所述全宏基因组读段经受包括去除非植物病原体读段在内的质量控制程序；e通过将剩余读段分解成一组样品来源的约300个碱基对的k-mer，将所述读段与来自已知真菌的一个或多个k-mer阵列进行比较；以及f分析所述k-mer模式读段表以根据与已知真菌亚型或具有已知结果或分类学组成的其他生物样品的比较k-mer分析来确定生物样品；以及g将关于所确定的植物病原体群体的抗性的信息输入到抗性热图和或抗性预测模块中，所述信息包括在所述样品中确定的每个单独品种以及每个单独品种的出现。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 先正达农作物保护股份公司 作物病原体监测和群体预测
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