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申请/专利权人：杭州灵思智康科技有限公司
摘要：本发明公开了一种基于强化学习和上下文无关文法的核酸序列生成方法，通过上下文无关文法树描述核酸序列的结构，智能体使用基于自注意力机制的神经网络对核酸序列的文法树进行编码和处理，选择非终结符和产生式规则，并作为行动传送给环境，环境根据智能体的行动更新核酸序列的文法树，生成新的环境，奖励函数根据当前环境信息评估智能体的行动，返回一个奖励数值，用于指导智能体的下一步行动，重复以上操作，直到环境确定当前核酸序列已经生成完毕，可解决SELEX筛选实验中随机文库含有大量的无用序列的问题。
主权项：1.一种基于强化学习和上下文无关文法的核酸序列生成方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、提供需要的核酸二级结构和碱基数量的约束，和初始的上下文无关文法树，共同构成初始的环境；S2、将环境作为智能体可以观察到的内容，传送给智能体；S3、智能体使用神经网络，对观察到的环境进行编码和处理；S4、智能体根据步骤S3中的编码和处理，从当前环境的上下文无关文法树的可选的非终结符列表中选择一个非终结符，再选择一个该非终结符对应的产生式，该非终结符和对应的产生式规则即为智能体的行动；S5、将步骤S4中智能体的行动传送给环境；S6、环境根据智能体的行动更新核酸序列的文法树，生成新的环境；S7、奖励函数根据当前环境信息评估智能体的行动，得到一个奖励数值，该数值用于使用强化学习算法指导智能体的更新；S8、重复步骤S2至步骤S7，直到环境确定当前核酸序列已经生成完毕；S9、结束模型流程后，输出生成的核酸序列和其对应的文法树。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 杭州灵思智康科技有限公司 一种基于强化学习和上下文无关文法的核酸序列生成方法
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