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DNA序列组装方法 

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申请/专利权人:上海图灵智算量子科技有限公司

摘要:本发明涉及到DNA序列组装方法。基于伊辛机量子退火的DNA序列组装方法如通过全基因组鸟枪法,得到巨量有序NDA片段,将有序DNA片段构建成有向图,根据有向图构建伊辛哈密顿的参数并带入伊辛机量子退火,伊辛量子退火演化的结果就是每个节点在环路中的位置,其实也就是每个DNA片段在组装顺序中的位置,根据DNA片段的组装序列复现整个DNA的完整序列。

主权项:1.一种DNA序列组装方法,其特征在于,包括:建立DNA片段的有向图,根据所述有向图构建伊辛哈密顿量,其在退火当中用于在所述有向图中寻找权重值之和最小的路径,由所述伊辛哈密顿量的退火演化结果复现整个DNA的完整序列;在所述有向图为每一对有序的节点对分配一条有向边;每一条所述有向边分配有权重值,权重值用于评估所述有向边两端的一对节点所代表的两个DNA片段的重叠程度。

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