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一种蛋白纳米孔氨基酸序列的筛选方法、蛋白纳米孔及其应用 

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申请/专利权人:南方科技大学

摘要:本发明提供一种蛋白纳米孔氨基酸序列的筛选方法、蛋白纳米孔及其应用。所述筛选方法包括:评估双孔结构的特征序列,利用模型搜索与所述双孔结构的特征序列相匹配的氨基酸序列,去除冗余候选序列后进行定位和筛选,计算候选序列的匹配长度和包络长度,再进行配准得到与已知的蛋白纳米孔的相对失配关系,分析得到最终序列。通过该方法筛选得到的氨基酸序列形成的蛋白纳米孔与已知T2SS、T3SS以及T4SS的分泌素蛋白相似度较低,所述蛋白纳米孔特有的序列缩小了孔的内径,使其通道孔径较小且选择性较高,是一类新型的选择性较好的蛋白纳米孔,能够应用于在物质检测或海水淡化等多个领域。

主权项:1.一种蛋白纳米孔,其特征在于,所述蛋白纳米孔包含中央门特征序列、帽门特征序列和等电点决定序列;所述等电点决定序列的氨基酸序列如SEQIDNO.5所示;所述帽门特征序列的氨基酸序列如SEQIDNO.6所示;所述中央门特征序列的氨基酸序列如SEQIDNO.7或SEQIDNO.8所示。

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权利要求:

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