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一种基于平皿法培养的微生物菌落的物种识别方法 

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申请/专利权人:浙江天科高新技术发展有限公司

摘要:本发明提供了一种基于平皿法培养的微生物菌落识别方法,本发明可以利用用户上传的菌落图片,通过计算机识别的方案将图片中所有的菌落按照位置,大小进行标注,标注出的物种按照不同的物种进行颜色区分。本发明利用菌落的形态特征和颜色进行比对,对该样本的物种鉴定做出了判定结果。本发明无需其他的设备与操作,只需要上传图片并运行程序,即可对图片中的所有菌落进行标注和鉴定;操作过程没有门槛,节约了分析成本和时间成本,支持批量操作,避免了系统资源的长期占用;建立了平皿法培养的微生物菌落特有的识别模型。

主权项:1.一种基于平皿法培养的微生物菌落的物种识别方法,其特征在于,包括:1通过对平皿法培养的微生物进行采样、培养和物种鉴定获得用于训练的原始数据,通过样本鉴定数据和图片的标注形成一个物种-菌落信息相对应的表,通过开源的labelImg软件将菌落物种信息在图片中的位置进行标注,生成用于训练的数据集并随机分为训练集和测试集;2通过tensorflow深度学习框架的目标检测模型编写算法程序,对获得的测试集和训练集进行训练,获得并输出一个用于平皿法培养的微生物菌落识别的模型;3将需要识别的菌落图片上传,编写代码对需要识别的图片进行名字和文件格式的初步筛选和统一,挑出符合要求的图片;4编写识别代码,通过训练出来的识别模型对经过处理的图片进行批量的识别,在识别的过程中判断阈值,将大于阈值的菌落进行物种和阈值标注。

全文数据:

权利要求:

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