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下一代测序中的初步分析 

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申请/专利权人:元素生物科学公司

摘要:本公开描述了图像数据分析,其特别地标识用于在DNA测序期间在数字化流动池图像中进行碱基识别的簇位置。固定在支持物上的每个核酸模板分子可以包括插入序列和样品索引序列。所述样品索引序列可以包括k‑聚体序列。测序系统可以在进行插入序列测序反应的一个或多个循环之前进行所述k‑聚体序列的测序反应的k个循环,并生成第一多个流动池图像。可以针对所述第一多个流动池图像的像素来确定像素强度。可以基于像素强度和所述像素强度的相应颜色纯度来确定碱基识别模板并且所述碱基识别模板包括碱基识别位置。所述碱基识别模板可以在所述k个循环之后的一个或多个循环中对所述支持物的第二多个流动池图像进行配准。

主权项:1.一种方法,其包括:提供固定在支持物上的多个核酸模板分子,其中每个核酸模板分子包含:第一插入序列和第一样品索引序列,其中所述第一样品索引序列包括k-聚体序列和第一通用样品索引序列,第一通用样品索引标识所述插入序列的样品源;在进行所述插入序列的测序反应的一个或多个循环之前,由测序系统进行所述k-聚体序列的测序反应的k个循环,从而生成第一多个流动池图像;由处理器来确定所述第一多个流动池图像的像素、像素强度以及所述像素强度中的每一者的相应颜色纯度;以及由所述处理器基于所述像素强度和所述像素强度的所述相应颜色纯度来确定包括碱基识别位置的碱基识别模板,其中所述碱基识别模板被配置用于在所述k个循环之后的一个或多个循环中对所述支持物的第二多个流动池图像进行配准。

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权利要求:

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