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申请/专利权人：清华大学
摘要：本申请涉及一种分子动力学模拟的作用力分析方法、装置、和计算机设备。所述方法包括：获取当前进程的本地原子的数目和其对应的邻居列表，并基于所述当前进程的本地原子的数目，确定所述当前进程适配的各组邻接表的组数和分配内存值；将各所述本地原子进行分组处理，得到各原子组，并基于各所述目标原子组中的各本地原子对应的邻居列表、以及所有组邻接表的分配内存值，通过邻接表构建策略，构建各目标组邻接表；基于每个目标组邻接表、每个目标邻接表对应的各目标原子组、以及各所述本地原子的三维坐标，计算所述当前进程的各本地原子的分子受力结果。采用本方法能够提升分子动力学模拟各本地原子的分子受力结果的效率。
主权项：1.一种分子动力学模拟的作用力分析方法，其特征在于，所述方法包括：获取当前进程的本地原子的数目、以及每个本地原子对应的邻居列表，并基于所述当前进程的本地原子的数目，确定所述当前进程适配的各组邻接表的组数、以及所有组邻接表的分配内存值；基于所述当前进程适配的各组邻接表的组数，将各所述本地原子进行分组处理，得到各原子组，并在各所述原子组中，随机筛选目标原子组、以及目标原子组中的各本地原子对应的邻居列表；基于所述目标原子组中的各本地原子对应的邻居列表、以及所有组邻接表的分配内存值，通过邻接表构建策略，构建目标组邻接表，并在各非目标原子组中，重新筛选目标原子组；每个原子组只能够筛选一次；返回执行基于所述目标原子组中的各本地原子对应的邻居列表，通过邻接表构建策略，构建目标组邻接表步骤，得到多个目标组邻接表，并基于每个目标组邻接表、每个目标邻接表对应的各目标原子组、以及各所述本地原子的三维坐标，计算所述当前进程的各本地原子的分子受力结果。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 清华大学 分子动力学模拟的作用力分析方法、装置、和计算机设备
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