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一种用于MH测序数据的混合DNA概率分型方法 

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申请/专利权人:四川大学

摘要:本发明公开了一种用于MH测序数据的混合DNA概率分型方法。包括以下步骤:步骤1:根据单一个体来源DNA的MH测序数据得到先验参数;步骤2:获取待检混合DNA样本MH测序数据的特征信息;步骤3:根据测序信息,滤除噪声序列;步骤4:根据先验参数和特征信息,在控方假设和辩方假设下分别构建似然函数,计算控方假设和辩方假设的似然比;步骤5:根据似然函数值大小对可能的基因型组合进行排序;本发明用于法医DNA分析工作中常见的混合DNA样本的检测,可以客观、准确的解析混合DNA的MH测序数据的结果,有效减少了分析过程中的不确定性和主观误差,显著提高法医混合DNA的MH‑MPS数据分析的准确性、科学性。

主权项:1.一种用于MH测序数据的混合DNA概率分型方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1:根据单一个体来源DNA的MH测序数据构造训练集,根据训练集估计得到先验参数;步骤2:获取待检混合DNA样本MH测序数据的特征信息,特征信息包括混合DNA的MH分型和定量信息、目的个体分型信息、参考个体分型信息和相关参数;步骤3:根据测序信息,滤除噪声序列;步骤4:根据步骤1得到的先验参数和步骤2得到的特征信息,在控方假设和辩方假设下分别构建似然函数,根据似然函数计算控方假设和辩方假设的似然比;控方假设为:目的个体和n个未知个体是混合DNA样本的贡献者,或目的个体、参考个体和n-1个未知个体是混合DNA样本的贡献者;辩方假设为:n+1个未知个体是混合DNA样本的贡献者,或参考个体和n个未知个体是混合样本的贡献者;目的个体即怀疑为混合DNA样本贡献者之一的个体;参考个体即已确定为混合DNA样本贡献者之一的个体;步骤5:计算每个基因座上所有可能的基因型组合的似然函数值,得到基因座似然函数值大小排序结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 四川大学 一种用于MH测序数据的混合DNA概率分型方法

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