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申请/专利权人：中国科学院上海营养与健康研究所;国科大杭州高等研究院
摘要：本发明提供了一种结肠癌患者DNA甲基化测序数据的处理方法、处理系统及存储介质。所述处理方法包括以下步骤：获取多个结肠癌转移样本和未发生转移样本的DNA甲基化测序数据并进行差异分析，以确定差异DNA甲基化位点；对所述差异DNA甲基化位点进行单因素Cox回归分析，并进行SVM‑RFE分析，以筛选与结肠癌转移诊断相关的第一DNA甲基化生物标志物，并构建关于所述第一DNA甲基化生物标志物的诊断模型；对所述第一DNA甲基化生物标志物进行逻辑斯特回归分析，筛选与结肠癌无进展生存期相关的第二DNA甲基化生物标志物，并构建关于所述第二DNA甲基化生物标志物的预后模型。
主权项：1.一种结肠癌患者DNA甲基化测序数据的处理方法，其特征在于，包括以下步骤：获取多个结肠癌转移样本及多个未转移样本的DNA甲基化测序数据；对所述多个结肠癌转移样本及所述多个未转移样本的DNA甲基化测序数据进行差异分析，以确定差异DNA甲基化位点；根据各所述DNA甲基化测序数据对应的样本标签，对所述差异DNA甲基化位点进行单因素Cox回归分析，以确定与结肠癌预后相关的候选DNA甲基化生物标志物；根据各所述DNA甲基化测序数据对应的样本标签，采用SVM-RFE算法筛选与结肠癌转移诊断相关的第一DNA甲基化生物标志物；使用逻辑斯特回归算法，构建关于所述第一DNA甲基化生物标志物的诊断模型；以及经由所述诊断模型，处理结肠癌患者的DNA甲基化测序数据。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院上海营养与健康研究所 国科大杭州高等研究院 DNA甲基化测序数据的处理方法、处理系统及存储介质
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