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申请/专利权人：山东省计算中心(国家超级计算济南中心)

摘要：本发明公开了基于超算互联网的RNA结构预测方法及系统，包括：获取待预测的RNA序列；对待预测的RNA序列进行编辑；对编辑后的RNA序列，进行RNA二级结构预测，得到RNA二级结构预测结果；从RNA二级结构预测结果中进行文件提取，得到文件提取结果；基于RNA二级结构文件提取结果和待预测的RNA序列，进行RNA三级结构预测，得到RNA三级结构预测结果；比较RNA三级结构预测结果与参考结构之间的差异，通过多个指标对差异进行衡量，选择最优的预测结构作为最终结构；其中，对待预测的RNA序列进行编辑、进行RNA二级结构预测和进行RNA三级结构预测；均调度多个超算算力资源进行实现。

主权项：1.基于超算互联网的RNA结构预测方法，其特征是，包括：获取待预测的RNA序列；对待预测的RNA序列进行编辑；对编辑后的RNA序列，进行RNA二级结构预测，得到RNA二级结构预测结果；从RNA二级结构预测结果中进行文件提取，得到文件提取结果；基于RNA二级结构文件提取结果和待预测的RNA序列，进行RNA三级结构预测，得到RNA三级结构预测结果；比较RNA三级结构预测结果与参考结构之间的差异，通过多个指标对差异进行衡量，选择最优的预测结构作为最终结构；其中，对待预测的RNA序列进行编辑、进行RNA二级结构预测和进行RNA三级结构预测；均调度多个超算算力资源进行实现；对待预测的RNA序列进行编辑；具体包括：采用RNA序列编辑工具EditSequence，提取待编辑RNA序列中的某条链或者选中指定序列片段进行编辑，对选中部分片段进行重命名，交换和删除操作来实现；所述RNA序列编辑工具，被集成于Galaxy平台；RNA序列编辑工具，接收用户提交的序列信息和工具操作需求，根据序列数据量大小、工具的运行命令和工具自身配置，分析用户所需资源需求如CPU数量和内存大小，并将资源需求申请和工具运行命令发送给超算互联网调度系统；超算互联网调度系统，用于接收RNA序列编辑工具，RNA二级结构预测工具和RNA三级结构预测工具的超算资源需求申请，将工具运行命令发送到目标超算集群；目标超算集群接收调度并执行作业，在计算完成后将结果返回；RNA结构预测方法集成了RNA序列编辑工具,RNA二级结构预测工具,RNA三级结构预测工具，RNA结构比较工具。

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