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申请/专利权人：广东药科大学

摘要：本发明公开了一种修饰位点识别方法、系统、装置及存储介质，该方法包括：获取蛋白质乙酰化修饰位点和对应的蛋白质乙酰化氨基酸序列片段；对蛋白质乙酰化氨基酸序列片段中的氨基酸进行二维矩阵转换；对蛋白质乙酰化二维矩阵特征进行连续小波变换操作；将尺度矩阵输入至深度卷积神经网络模型，输出蛋白质乙酰化位点的识别结果。该系统包括：序列获取模块、矩阵特征获取模块、尺度矩阵获取模块和识别模块。通过使用本发明，可在蛋白质组尺度识别蛋白质乙酰化修饰位点，具有准确、快速、成本低等优点。本发明作为一种修饰位点识别方法、系统、装置及存储介质，可广泛应用于蛋白质翻译后修饰位点识别领域。

主权项：1.一种修饰位点识别方法，其特征在于，包括以下步骤：获取蛋白质乙酰化修饰位点和对应的蛋白质乙酰化氨基酸序列片段；对蛋白质乙酰化氨基酸序列片段中的氨基酸进行二维矩阵转换，得到蛋白质乙酰化二维矩阵特征；基于小波变换函数，对蛋白质乙酰化二维矩阵特征进行连续小波变换操作，得到尺度矩阵；将尺度矩阵输入至深度卷积神经网络模型，输出蛋白质乙酰化位点的识别结果；所述获取蛋白质乙酰化修饰位点和对应的蛋白质乙酰化氨基酸序列片段这一步骤，其具体包括：获取蛋白质蛋白质乙酰化修饰位点；以蛋白质乙酰化修饰位点为中心，截取上游和下游分别包含10个氨基酸残基的序列片段，得到对应的蛋白质乙酰化氨基酸序列片段；所述对蛋白质乙酰化氨基酸序列片段中的氨基酸进行二维矩阵转换，得到蛋白质乙酰化二维矩阵特征这一步骤，其具体包括：将20种天然氨基酸残基分别定义为大小为7×5的二维特征矩阵，得到定义矩阵；根据定义矩阵，将对应的蛋白质乙酰化氨基酸序列片段转化为蛋白质乙酰化二维矩阵特征；所述基于小波变换函数，对蛋白质乙酰化二维矩阵特征进行连续小波变换操作，得到尺度矩阵这一步骤，其具体包括：预设小波变换函数和尺度；根据小波变换函数和蛋白质乙酰化二维矩阵特征的行特征，依次改变小波变换尺度并进行连续小波变换，得到每一个尺度下对应的变换系数；以每一个尺度下对应的变换系数为行向量，构建尺度矩阵；所述深度卷积神经网络模型的构建步骤具体包括：收集蛋白质乙酰化位点数据信息并采用预定义的氨基酸二维特征矩阵、小波变换函数和尺度进程处理，得到第一训练尺度矩阵；根据收集的蛋白质乙酰化位点数据信息，得到非蛋白质乙酰化修饰位点序列；对于非蛋白质乙酰化修饰位点序列，采用预定义的氨基酸二维特征矩阵、小波变换函数和尺度进程处理，得到第二训练尺度矩阵；以第一训练尺度矩阵作为输入数据正样本、第二训练尺度矩阵作为输入数据负样本；抽取预设比例的输入数据正样本、对应的输出数据正样本标记、输入数据负样本和对应的输出数据负样本标记，作为训练集对所述深度卷积神经网络模型进行训练；抽取预设比例的输入数据正样本、对应的输出数据正样本标记、输入数据负样本和对应的输出数据负样本标记，作为测试集对所述深度卷积神经网络模型进行测试。

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