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制备DNA文库和检测逆转录病毒整合位点的方法 

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申请/专利权人:南京传奇生物科技有限公司

摘要:本公开属于分子生物学领域特别是基因分析检测技术领域,具体地,涉及一种制备DNA文库的方法和检测逆转录病毒整合位点的方法。具体地,所述制备DNA文库的方法,包括如下步骤:1将被逆转录病毒感染的细胞的基因组DNA片段化,得到DNA片段;2将DNA片段的末端修复加并连接上接头得到连接产物;其中,所述接头为包括长链序列和短链序列的不对称双链接头,其中所述长链序列自5′端至3′端依次包含固定序列、随机UMI序列以及扩增引物结合序列,所述短链序列包含与所述固定序列互补的序列;以及其它步骤。本公开的检测方法具有极高的灵敏度,具有良好的应用潜力。

主权项:一种制备DNA文库的方法,包括如下步骤:1将被逆转录病毒感染的细胞的基因组DNA片段化,得到DNA片段;2将DNA片段的末端修复加并连接上接头,得到连接产物;其中,所述接头为包括长链序列和短链序列的不对称双链接头,其中所述长链序列自5’端至3’端依次包含固定序列、随机UMI序列以及扩增引物结合序列,所述短链序列包含与所述固定序列互补的序列;3用LTR序列的引物、内参基因序列的引物和接头序列的引物对连接产物进行第一轮PCR,得到第一轮PCR产物;4用与步骤3中不同的LTR序列的引物、内参基因序列的引物和接头序列的引物对第一轮PCR产物进行第二轮PCR,得到第二轮PCR产物;5用带有测序接头的引物对第二轮PCR产物进行第三轮PCR,得到第三轮PCR产物,为DNA文库。

全文数据:

权利要求:

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