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申请/专利权人:安徽元构生物科技有限公司
摘要:本发明提供一种核酸主链结构的生成方法、装置,该方法包括:获取碱基序列的随机初始位置;基于碱基序列中空间距离小于预设阈值的两两碱基之间的结构能量确定当前步的更新梯度;基于当前步的更新梯度、碱基序列的随机初始位置以及碱基结构生成模型,生成当前步的碱基序列的当前位置,并基于当前步碱基序列的当前位置更新随机的碱基序列的随机初始位置,直至基于第预设步的碱基序列的当前位置确定对应的核酸主链结构。本发明提供的方法,基于更新梯度作为先验知识,约束碱基结构生成模型进行碱基位置生成,基于最后得到的碱基序列的生成位置,生成核酸主链结构,实现从头生成核酸主链结构,大大提升核酸主链结构生成的可靠性和结构稳定性。
主权项:1.一种核酸主链结构的生成方法,其特征在于,包括:获取碱基序列的随机初始位置;基于所述碱基序列中空间距离小于预设阈值的两两碱基之间的结构能量,确定当前步的更新梯度;所述结构能量用于描述碱基之间结构的稳定性;基于所述当前步的更新梯度、所述碱基序列的随机初始位置以及碱基结构生成模型,生成当前步的碱基序列的当前位置,并基于所述当前步碱基序列的当前位置更新所述随机的碱基序列的随机初始位置,直至基于第预设步的碱基序列的当前位置,确定碱基序列的生成位置;所述碱基结构生成模型是基于样本碱基序列和初始扩散模型进行训练得到的;基于所述碱基序列的生成位置,确定所述碱基序列的生成位置对应的核酸主链结构。
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权利要求:
百度查询: 安徽元构生物科技有限公司 核酸主链结构的生成方法、装置
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