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申请/专利权人:上海大学
摘要:本发明公开了一种搜索化学反应的最低反应路径的方法及系统,首先指定化学反应的过渡态的坐标,定义化学反应过程的反应坐标;然后将限制势加入原有势能面中,并以能量下降的方向向反应物、产物两侧以设定步长搜索反应路径,得到最低反应路径坐标的构型;再对得到的各个构型的坐标分量插值,得到期望反应坐标的构型。本发明在已有势能面上从过渡态向反应物、产物两侧搜索最低反应路径的方法,以克服最低能量路径无法连接反应物或产物的缺点。本发明要求的代码量小,在普通电脑中即可快速运行得到结果,计算效率高,精确度有保证。
主权项:1.一种搜索化学反应的最低反应路径的方法,其特征在于,包括如下步骤:1指定化学反应的过渡态的坐标,定义化学反应过程的势能面上的反应坐标;2将限制势加入原有势能面中,并按能量下降的方向向反应物、产物两侧以设定步长搜索反应路径,得到最低反应路径上一系列反应坐标对应的构型;3当在所述步骤2中得到的各个构型存在反应坐标明显偏离期望反应坐标时,对在所述步骤2中得到的各个构型的坐标分量插值,得到期望反应坐标的构型;在所述步骤1中,通过数学方法进行优化,得到过渡态几何构型,确认过渡态为势能面上的一阶鞍点;根据过渡态的坐标,定义反应坐标变换公式,将任意时刻的3N个笛卡尔坐标变换到一维反应坐标ξ,N是当前反应的原子数量;在所述步骤2中,在原有势能面上加入限制势函数f=Kξ-ξref2,得到新的势能V=V0+f,其中V0是原始势能面的能量,K表示控制该限制势的大小,ξref表示是期望的反应坐标;首先向正向搜索,其次往负方向搜索,设定搜索步长,在每一步中执行梯度下降法或任意优化方法,从而在限制势函数的限制下搜索能量极小值,其中R表示每一步的列坐标、表示势能的梯度,α为优化步长,k为当前步序数。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 上海大学 搜索化学反应的最低反应路径的方法及系统
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