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一种大鼠睾丸生精小管分期方法 

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申请/专利权人:成都华西海圻医药科技有限公司

摘要:一种大鼠睾丸生精小管分期方法,涉及图像处理领域,其步骤为:扫描睾丸染色切片;识别出需要的睾丸组织并将其转换为ROI1;在ROI1上筛选出趋近于圆形、环形、类圆的生精小管;将筛选出的生精小管识别为不同周期的生精小管,并将Stage1、Stage12‑13、无法分期的小管分别输出为ROI2、ROI3、ROI4;调用细胞核识别算法进行细胞核识别;将识别出的细胞核划分出减数分裂细胞,在ROI2、ROI3、ROI4中将减数分裂细胞数大于或等于预设值N的生精小管归类为Stage14小管,最终统计出每个周期的生精小管数以及生精小管总数。本发明能实现睾丸生精小管分期人工智能化,实现快速准确的批量操作。

主权项:1.一种大鼠睾丸生精小管分期方法,其特征在于,包括下述步骤:S1、切片扫描:使用数字切片扫描仪扫描大鼠睾丸HE染色切片;S2、睾丸组织识别:在所述染色切片上识别出需要的横切面的睾丸组织并将其转换为第一感兴趣区域ROI1;S3、生精小管识别及分割:在所述第一感兴趣区域ROI1上分割出独立的生精小管,筛选出所需的趋近于圆形、环形、类圆的生精小管并做出对应标记,并将其余生精小管标记为背景;S4、生精小管周期识别:将所述筛选出的趋近于圆形、环形、类圆的生精小管识别标记为不同周期的生精小管,分为Stage1、Stage2-3、Stage4-5、Stage6-7、Stage8、Stage9-10、Stage11、Stage12-13、无法分期的小管,并将Stage1小管、Stage12-13小管、无法分期的小管分别输出为第二感兴趣区域ROI2、第三感兴趣区域ROI3、第四感兴趣区域ROI4;S5、细胞核识别:在所述第二感兴趣区域ROI2、第三感兴趣区域ROI3、第四感兴趣区域ROI4上调用细胞核识别算法进行细胞核识别,识别出的细胞核全部做出对应标记,非细胞核区域标记为背景;S6、减数分裂细胞识别:将步骤S5识别出的细胞核进行识别划分,对减数分裂细胞做出一种标记,其他细胞做出另一种标记,在所述第二感兴趣区域ROI2、第三感兴趣区域ROI3、第四感兴趣区域ROI4中将减数分裂细胞数大于或等于预设值N的生精小管归类为Stage14小管,减数分裂细胞数小于预设值N的生精小管保持为原来的Stage1小管、Stage12-13小管、无法分期的小管,N为大于0的正整数;S7、结果输出:在步骤S4得到的Stage1、Stage2-3、Stage4-5、Stage6-7、Stage8、Stage9-10、Stage11、Stage12-13、无法分期的小管划分结果中,将Stage1小管、Stage12-13小管、无法分期的小管采用步骤S6得到的Stage1小管、Stage12-13小管、无法分期的小管替换,再加上步骤S6得到的Stage14小管,得到最终的Stage1、Stage2-3、Stage4-5、Stage6-7、Stage8、Stage9-10、Stage11、Stage12-13、Stage14生精小管分期结果,再统计出每个周期的生精小管数以及生精小管总数。

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