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微卫星不稳定性检测模型的构建方法、检测方法及电子装置 

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申请/专利权人:北京优迅医疗器械有限公司

摘要:本发明提供了一种微卫星不稳定性检测模型的构建方法、检测方法及电子装置。该构建方法包括:S1计算并获得参考集样本中所有样本的微卫星位点的微卫星突变频率,合并后获得参考集特征矩阵;参考集中的样本包括微卫星稳定样本和微卫星不稳定样本;S2对参考集特征矩阵进行机器学习,获得微卫星不稳定检测模型;微卫星不稳定检测模型中含有参考集特征向量和微卫星不稳定判断阈值。能够解决现有技术中难以实现单样本的微卫星不稳定性检测的问题,适用于微卫星不稳定性检测领域。

主权项:1.一种微卫星不稳定性检测模型的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括:S1计算并获得参考集样本中所有样本的微卫星位点的微卫星突变频率,合并后获得参考集特征矩阵;所述参考集中的样本包括微卫星稳定样本和微卫星不稳定样本;S2对所述参考集特征矩阵进行机器学习,获得所述微卫星不稳定检测模型;所述微卫星不稳定检测模型中含有参考集特征向量和微卫星不稳定判断阈值;所述微卫星位点选自如下任意一种或多种:chr22:29682882-29682893、chr3:52696311-52696321、chr21:42873556-42873563、chrX:44949952-44949962、chr1:161309336-161309346、chr3:149290606-149290615、chr22:29690901-29690911、chr14:68944322-68944332、chr2:212495337-212495347、chr12:12030237-12030252、chr9:87487519-87487529、chr6:109319968-109319978、chr17:40468976-40468987、chr3:71008351-71008354、chr2:158637137-158637150、chr11:94212931-94212941、chr1:245977726-245977735、chr5:170818291-170818300、chr5:67584513-67584524、chr2:141625631-141625641、chr9:8484398-8484407、chr19:50911948-50911959、chr14:65542680-65542691、chr17:30320861-30320871、chr21:42838094-42838103、chr17:47696765-47696774、chr2:46583273-46583282、chr2:192011486-192011496、chr7:140421096-140421107、chr7:140489020-140489029、chr6:32790100-32790109、chr1:46597497-46597507、chr3:30691872-30691881、chrX:70608764-70608773、chr4:1919853-1919862、chr20:39702015-39702027和chr14:68944344-68944357。

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