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一种彩色马铃薯花青素相关的SNP-CAPS分子标记与鉴定 

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摘要:本发明公开了一种彩色马铃薯花青素相关的SNP‑CAPS分子标记与鉴定,涉及马铃薯育种及分子遗传学技术领域。本发明通过对不同块茎发育时期的紫色薯肉(紫彩3号)和黄色薯肉(陇薯7号)进行转录组测序及单核苷酸多态性(SNP)位点分析,发现二者在马铃薯花青素合成基因StCHS的CDS区中存在一个非同义单核苷酸突变。根据该单核苷酸的差异开发了CAPS分子标记CAPS9‑325,该CAPS分子标记准确性高、重复性好,可以快速有效检测不同马铃薯基因组中是否含有StCHS功能基因以及其纯、杂和状态,进而筛选出具有花青素的马铃薯材料,以在早期进行分子标记辅助选择育种,有利于加速高花青素彩色马铃薯新品种的育种进程。

主权项:1.一种彩色马铃薯花青素相关的SNP-CAPS分子标记,其特征在于,所述CAPS分子标记为CAPS9-325,所述分子标记是基于马铃薯StCHS基因的CDS区chr9_2.77858834上的一个SNP位点而开发的CAPS引物,其多态性为A或G。

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百度查询: 内蒙古农业大学 一种彩色马铃薯花青素相关的SNP-CAPS分子标记与鉴定

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