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针对Herbaspirillum菌属特异性FISH探针的设计 

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摘要:本发明涉及生物技术领域,具体而言,涉及针对Herbaspirillum菌属特异性FISH探针的设计,一种针对Herbaspirillum菌属特异性FISH探针的设计方法,其特征在于,所述方法包含以下步骤:1筛选数据库;2设计探针;3利用步骤2的探针在序列库中匹配、错配情况统计;4探针效果的验证。目前没有草螺菌属特异性FISH探针,故我们自主设计Herbaspirillum菌属FISH特异性探针以期进行草螺菌在临床及基础研究中的探索。本次引物设计采用silva138.1的数据库筛选到Herbaspirillu菌属rRNASSU核糖体小亚基序列,根据目标16S序列库中全部共有序列,排除掉其中的非特异性区域,列出全部可能的FISH探针序列。将上述候选探针序列与全部非目标序列库进行匹配,挑选特异性最高的1条探针。

主权项:1.一种针对Herbaspirillum菌属特异性FISH探针的设计方法,其特征在于,所述方法包含以下步骤:1筛选数据库;2设计探针;3利用步骤2的探针在序列库中匹配、错配情况统计;4探针效果的验证。

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百度查询: 重庆医科大学附属第二医院 针对Herbaspirillum菌属特异性FISH探针的设计

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