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申请/专利权人：浙江大学长三角智慧绿洲创新中心
申请日：2024-12-20
公开（公告）日：2025-01-21
公开（公告）号：CN119339796A
专利技术分类：.基因或蛋白质表达分型；表示比率估计或标准化[2019.01]
专利摘要：本申请公开了一种基于知识图谱最佳传输的细胞间信号传导推断方法、装置、设备及介质，涉及基因工程技术领域。本申请根据细胞类型数据库找到源细胞类型中不同细胞的源基因表达数据和目标细胞类型中不同细胞的目标基因表数据。基于配体‑受体相互作用知识图谱，获得源细胞类型和目标细胞类型之间存在相互作用关系的各个通路，构建通路集合；以传输总成本最小化为目标，采用scKGOT算法确定通路集合中每个通路的最佳传输成本矩阵。本申请能够更便捷地推断细胞间的通路，实现准确模拟细胞间的配体‑受体信号通路以推断细胞间通讯。
专利权项：1.一种基于知识图谱最佳传输的细胞间信号传导推断方法，其特征在于，包括：从细胞类型数据库获取源细胞类型的各个细胞的基因表达数据，作为源基因表达数据；从细胞类型数据库获取目标细胞类型的各个细胞的基因表达数据，作为目标基因表达数据；基于配体-受体相互作用知识图谱，获得源细胞类型和目标细胞类型之间存在相互作用关系的各个通路，构建通路集合；以传输总成本最小化为目标，采用scKGOT算法确定通路集合中每个通路的最佳传输成本矩阵。
百度查询： 浙江大学长三角智慧绿洲创新中心 一种基于知识图谱最佳传输的细胞间信号传导推断方法、装置、设备及介质
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