西南石油大学;四川省玉溪河灌区运管中心李平获国家专利权
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龙图腾网获悉西南石油大学;四川省玉溪河灌区运管中心申请的专利一种用于蛋白质相互作用关系预测的解耦图网络算法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117809733B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-25发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311814588.X,技术领域涉及:G16B5/00;该发明授权一种用于蛋白质相互作用关系预测的解耦图网络算法是由李平;李翊;付鑫;李雅杰;王泓淏;张洪瑞;周静;沈雅文;朱鑫鹏设计研发完成,并于2023-12-27向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种用于蛋白质相互作用关系预测的解耦图网络算法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种蛋白质相互关系预测的解耦图网络算法,涉及蛋白质相互关系预测技术领域,包括如下步骤:构建蛋白质相互作用图,计算在任意一种蛋白质相互关系存在的情况下同时存在另一种相互关系的条件概率以获得条件概率矩阵,对蛋白质节点进行初始词嵌入得到蛋白质向量表征,将蛋白质向量表征分别通过N个多层感知机得到不同蛋白质向量在各个类别的蛋白质向量表征,利用图神经网络在具体类别的蛋白质向量表征上进行更新,将蛋白质对的这N个类别的特征表示进行点积运算得到蛋白质相关关系并用条件概率矩阵进行约束,从而通过边的类别信息做分类预测。本发明将蛋白质的类别信息解耦出来进行分类预测并用条件概率进行约束,提高了预测的效果。
本发明授权一种用于蛋白质相互作用关系预测的解耦图网络算法在权利要求书中公布了:1.一种用于蛋白质相互作用关系预测的解耦图网络算法,其特征在于,包括如下步骤:构建蛋白质相互作用图;遍历数据集,计算在任意一种蛋白质相互关系存在的情况下同时存在另一种相互关系的条件概率,组成N*N的条件概率矩阵,其中,N为蛋白质的相互作用关系类型数;对蛋白质节点进行初始词嵌入得到蛋白质向量表征;将蛋白质向量表征分别通过N个多层感知机得到不同蛋白质向量在各个类别的特征向量表示,从而将蛋白质向量表征中的N个类别信息解耦出来;利用图神经网络在具体类别的蛋白质向量表征上进行更新;所述利用图神经网络在具体类别的蛋白质向量表征上进行更新具体为,对N种不同类别的特征向量表示分别通过GIN进行卷积操作,根据蛋白质相互作用图,聚合邻居蛋白质节点的信息,再更新不同蛋白质节点的N个类别的特征表示;通过边索引提取边对应两端更新后的两个蛋白质节点的N个类别的蛋白质向量表征,分别将两个蛋白质对这N个类别的蛋白质向量表征进行点积运算得到蛋白质相关关系并用条件概率矩阵进行约束,从而通过边的类别信息做分类预测,此步骤具体为:通过边索引提取对应两端更新后的两个蛋白质节点的N个类别的特征表示;分别将两个蛋白质这N个类别的特征表示进行点积运算后再进行线性变换得到N个融合后的特征;将N个融合后的特征进行拼接后输入FC层进行特征压缩,降维后的结果与N*N条件概率矩阵相乘,获得预测结果。
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