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恭喜予果生物科技(北京)有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司;予果智造科技(北京)有限公司夏涵获国家专利权

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龙图腾网恭喜予果生物科技(北京)有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司;予果智造科技(北京)有限公司申请的专利一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114400048B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-03-28发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111643877.9,技术领域涉及:G16B30/10;该发明授权一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法是由夏涵;官远林;黎松;温颜华;胡龙;梁晓雪;穆西玉;史琦琦;宋雅丽设计研发完成,并于2021-12-30向国家知识产权局提交的专利申请。

一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法在说明书摘要公布了:本发明提供了一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法,所述方法筛选出候选的质粒序列并统计基本信息;再从公共数据库下载已知的质粒序列数据,同源聚类并去冗余构建参考数据库;对确定为质粒的序列进行特征分析,全面刻画细菌质粒基因组的特征图谱;评估质粒所携带的抗菌素耐药基因的风险等级及相应的拷贝数数量,整体评估质粒耐药基因的风险程度;统计各细菌的质粒信息并进行归类统计,从整体上描述用户提供的细菌基因组的完整质粒信息。本发明方法可作为院内获得性感染,社区获得性感染,抗菌素耐药性流行和预测的基础工具,对于研究细菌内部因水平基因转移而增加的菌种遗传多样性及受体菌获得新的生物学性状方面也会有积极作用。

本发明授权一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法在权利要求书中公布了:1.一种鉴定细菌质粒基因组及其特征图谱的综合性方法,其特征在于,所述方法包括:1从用户提供的细菌基因组文件中按照长度筛选出候选的质粒序列并统计基本信息,修改序列名字便于后续进行统计;2从公共数据库下载已知的质粒序列数据,同源聚类并去冗余构建参考数据库;3对确定为质粒的序列进行特征分析,全面刻画细菌质粒基因组的特征图谱;4结合步骤3质粒鉴定的特征,评估质粒所携带的抗菌素耐药基因的风险等级及相应的拷贝数数量,整体评估质粒耐药基因的风险程度;5统计各细菌的质粒信息并进行归类统计,从整体描述用户提供的细菌基因组的完整质粒信息;6分析菌株质粒之间的共线性来可视化菌株质粒结构变异的具体位置;挑选同种菌株的质粒按照序列长短信息依次上下排列位置或者支持通过菌株收集时间来进行排列来进行结果展示,每种菌株质粒都以特定的颜色进行区分;步骤2构建所述参考数据库是采用最优比对算法和参数将候选的细菌质粒序列与手动整理的数据库进行比对,结合具体的比对信息进行过滤,确定序列是否为质粒序列,并确定质粒序列对应数据库的来源和相应编号;所述步骤3特征分析包含质粒的类型和可接合转移能力分析,整合两个及两个以上耐药数据库获得质粒序列的耐药基因的数量和类别以及毒力因素。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人予果生物科技(北京)有限公司;西咸新区予果微码生物科技有限公司;予果智造科技(北京)有限公司,其通讯地址为:102600 北京市大兴区经济技术开发区地盛东路1号院6号楼501室;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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