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云南大学闵文文获国家专利权

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龙图腾网获悉云南大学申请的专利基于组织学图像的空间基因表达水平预测方法、装置及设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118629498B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-04发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410670366.3,技术领域涉及:G16B25/00;该发明授权基于组织学图像的空间基因表达水平预测方法、装置及设备是由闵文文;史志层;薛帅林设计研发完成,并于2024-05-28向国家知识产权局提交的专利申请。

基于组织学图像的空间基因表达水平预测方法、装置及设备在说明书摘要公布了:本发明涉及神经网络预测技术领域,公开了一种基于组织学图像的空间基因表达水平预测方法、装置及设备。该方法包括:通过DenseNet‑121模型获取图像块的视觉特征,通过基于多头注意力机制的测序点特征提取模型提取测序点的融合特征;采用对比学习的方法去优化增强模型的预测能力,从而实现准确地预测不同空间分辨率下组织学图像中的基因表达水平。本发明使用多模态融合方法,综合考虑了组织学图像信息、空间转录组学测序点的基因表达信息以及测序点的位置信息,可得到更准确的预测结果;本发明改善了预测基因表达水平效果,减少了误判率,并且可以准确识别癌症特异性基因。

本发明授权基于组织学图像的空间基因表达水平预测方法、装置及设备在权利要求书中公布了:1.一种基于组织学图像的空间基因表达水平预测方法,其特征在于,包括步骤:获取癌症患者的病理数据集,所述病理数据集包括组织学图像、与所述组织学图像对应的空间转录组基因表达数据以及测序点的位置坐标;根据每个测序点的位置坐标将所述组织学图像分割成以每个测序点为中心的预定像素大小的图像块,并将所述图像块与对应测序点的空间转录组基因表达数据配对;从所述空间转录组基因表达数据中选择所有组织切片中共同的基因以及每个组织切片中前1000个高可变基因,对每个测序点中的基因表达值进行归一化处理,得到测序点的基因表达归一化数据;将组织学图像分割成图像块后输入到预训练的DenseNet-121模型中,输出视觉特征;将测序点的基因表达归一化数据以及测序点的位置坐标输入到基于多头注意力机制的测序点特征提取模型中,输出融合特征;将所述视觉特征以及融合特征分别通过投影层投影到特征空间中,构建多模态嵌入空间;在多模态嵌入空间中,定义位于相同位置的测序点和图像块形成正样本对,位于不同位置的测序点和图像块形成负样本对,采用对比学习的方法减小所述正样本对之间的距离,同时增大所述负样本对之间的距离,得到优化的多模态嵌入空间;在所述优化的多模态嵌入空间中,计算待测组织学图像的视觉特征与所有测序点的融合特征之间的余弦相似度,找出具有最高相似度分数的前K个测序点的融合特征;在优化的多模态嵌入空间中,计算待测组织学图像的视觉特征与所述前K个测序点的融合特征之间的欧几里得距离,根据所述欧几里得距离的大小设计相应权重,将所述权重对应乘以所述前K个测序点的真实基因表达值并求和作为待测组织学图像的空间基因表达水平。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人云南大学,其通讯地址为:650091 云南省昆明市翠湖北路2号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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