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龙图腾网恭喜墨卓生物科技(浙江)有限公司申请的专利基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法、系统及设备获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119068975B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-08发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202411561767.1，技术领域涉及：G16B20/00；该发明授权基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法、系统及设备是由巢杉设计研发完成，并于2024-11-05向国家知识产权局提交的专利申请。

本基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法、系统及设备在说明书摘要公布了：本发明提供了一种基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法、系统及设备。本发明基于特征基因集在物种基因组内的出现规律，逐步搜索获取长度阈值与覆盖度阈值的最佳组合，用于对单细胞微生物基因组物种组装结果进行过滤，从而去除由背景read组装而成的污染contig。本发明提供的方法不仅克服了现有技术中无法自动判断长度阈值的缺陷，且在判定contig覆盖度阈值时，也无需假设物种的contig的覆盖度呈正态分布或是否多峰，从而实现了单细胞基因组组装结果中多胞污染以及背景污染的高通量检测且自动化去除，尽可能得到最优的污染去除结果。

本发明授权基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法、系统及设备在权利要求书中公布了：1.基于分类特征基因集去除单细胞微生物基因组物种组装结果中污染的方法，其特征在于，包括：依次去除Bin内多胞污染、背景污染；其中，去除Bin内背景污染的方法包括：组装去除多胞污染的Bin，对获得的去除多胞污染的组装结果进行评估，获得Bin的特征基因集，基于特征基因集确定Bin的分类信息、参考特征序列；其中，所述特征基因集由具有特征序列的特征基因构成；设定去除多胞污染的组装结果中contig的长度搜索边界、长度搜索步长、覆盖度搜索边界、覆盖度搜索步长，再逐步搜索contig的假设长度阈值、假设覆盖度阈值；将不同的假设长度阈值、假设覆盖度阈值进行组合，构成若干清理阈值，分别根据不同清理阈值对去除多胞污染的组装结果中具有特征基因的contig进行过滤，获得保留contig以及分布于保留contig中的特征序列；根据Bin的参考特征序列、保留contig的特征序列，评估各清理阈值下去除多胞污染的组装结果的完整度、污染度；以完整度、污染度为指标对各清理阈值下去除多胞污染的组装结果进行质量评级，根据质量评级选取最佳的清理阈值；根据最佳的清理阈值重新对去除多胞污染的组装结果中contig进行过滤，获得去除多胞污染、背景污染的组装结果；其中，所述根据Bin的参考特征序列、保留contig的特征序列，评估该清理阈值下去除多胞污染的组装结果的完整度、污染度的方法包括：确定保留contig中特征序列的种类数、保留contig中重复出现的特征序列的种类数；根据保留contig中特征序列的种类数与Bin的参考特征序列的种类数的比值，确定该清理阈值下去除多胞污染的组装结果的完整度；根据保留contig中重复出现的特征序列的种类数与Bin的参考特征序列的种类数的比值，确定该清理阈值下去除多胞污染的组装结果的污染度。

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