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恭喜北京大学;北京大学重庆大数据研究院周晓华获国家专利权

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龙图腾网恭喜北京大学;北京大学重庆大数据研究院申请的专利一种基于潜在类别模型的SNP检测算法性能评估方法和系统获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119028430B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-22发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202411106125.2,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种基于潜在类别模型的SNP检测算法性能评估方法和系统是由周晓华;宋倩倩;李仕海设计研发完成,并于2024-08-13向国家知识产权局提交的专利申请。

一种基于潜在类别模型的SNP检测算法性能评估方法和系统在说明书摘要公布了:本发明涉及一种基于潜在类别模型的SNP检测算法性能评估方法和系统,属于基因测序技术领域,解决了无金标准时SNP检测算法性能评估不准确的问题。方法包括,获取多个SNP检测算法的检测结果后,将检测结果整合为二分类型结果;根据所有SNP检测算法的二分类型结果,在不同假设下基于潜在类别模型评估每个SNP检测算法的灵敏度和特异度;计算不同假设下成对SNP检测算法的相关性残差,基于所述相关性残差确定最优假设,得到所述最优假设下每种算法的灵敏度和特异度排序结果。实现了准确的SNP检测算法性能评估。

本发明授权一种基于潜在类别模型的SNP检测算法性能评估方法和系统在权利要求书中公布了:1.一种基于潜在类别模型的SNP检测算法性能评估方法,其特征在于,包括以下步骤:获取多个SNP检测算法的检测结果后,将检测结果整合为二分类型结果;根据所有SNP检测算法的二分类型结果,在不同假设下基于潜在类别模型评估每个SNP检测算法的灵敏度和特异度;计算不同假设下成对SNP检测算法的相关性残差,基于所述相关性残差确定最优假设,得到所述最优假设下每种算法的灵敏度和特异度排序结果;所述不同假设包括条件独立假设、常数随机效应假设和变化随机效应假设;采用以下公式计算成对SNP检测算法的相关性残差: ;其中,表示第个SNP检测算法和第个SNP检测算法间的相关性残差,表示第个SNP检测算法和第个SNP检测算法观测值间的相关系数,表示第个SNP检测算法和第个SNP检测算法期望值间的相关系数;在不同假设下采用以下方式评估每个SNP检测算法的灵敏度和特异度:构建不同假设下的潜在类别模型;基于所述潜在类别模型得到似然方程;采用EM算法迭代求解所述似然方程,得到每个SNP检测算法的灵敏度和特异度的最大似然估计值;成对SNP检测算法的相关性残差值最接近于0的假设为最优假设。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人北京大学;北京大学重庆大数据研究院,其通讯地址为:100871 北京市海淀区颐和园路5号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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