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高精(浙江安吉)精准医学科技有限公司张高获国家专利权

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龙图腾网获悉高精(浙江安吉)精准医学科技有限公司申请的专利基于单细胞测序数据的肿瘤细胞鉴定方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN118486374B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202410682103.4,技术领域涉及:G16B40/00;该发明授权基于单细胞测序数据的肿瘤细胞鉴定方法是由张高;胡亮;马楠设计研发完成,并于2024-05-29向国家知识产权局提交的专利申请。

基于单细胞测序数据的肿瘤细胞鉴定方法在说明书摘要公布了:本发明涉及肿瘤细胞检测技术领域,具体涉及一种基于单细胞测序数据的肿瘤细胞鉴定方法。本发明方法包括肿瘤细胞标志物获取模块和肿瘤细胞鉴定模块的构建流程;具体通过采用生物信息学算法和高通量测序技术,利用肿瘤细胞标志物获取模块在单细胞水平上实现了对肿瘤细胞中与程序性细胞死亡相关标志物的精准识别,从而为后续定量地评估细胞所属类别提供有力的数据支持。本发明还建立了一套完善的量化评估体系,在肿瘤细胞鉴定模块中,肿瘤细胞的鉴定综合考虑了多个分类模型,并对细胞所属类别进行了量化评估,能够全面、定量地鉴定细胞类型,为肿瘤研究提供更为全面的视角。

本发明授权基于单细胞测序数据的肿瘤细胞鉴定方法在权利要求书中公布了:1.一种基于单细胞测序数据的肿瘤细胞鉴定方法,其特征在于,包括肿瘤细胞标志物获取模块和肿瘤细胞鉴定模块:所述肿瘤细胞标志物获取模块用于识别肿瘤细胞中特异性表达的程序性细胞死亡相关基因,所获得的标志物是肿瘤细胞中与程序性细胞死亡相关的差异基因,具体包括以下步骤:步骤S11:获取程序性细胞死亡相关的基因集合和肿瘤组织单细胞测序数据,对数据进行质控,使用copyKAT软件推断细胞拷贝数变异;步骤S12:提取输出结果中的预测内容,获得包含细胞名称和细胞染色体倍数的细胞类型文件cell_type;步骤S13:读取单细胞基因表达矩阵,根据细胞名称整合cell_type文件内容;步骤S14:基于染色体倍数标注进行分组,染色体倍数标注为diploid的归为正常细胞组Normal,染色体倍数标注为aneuploid的归为肿瘤细胞组Tumor;步骤S15:使用差异分析软件limma比较Normal和Tumor组之间的基因表达水平以确定在不同组间存在显著差异的基因,获取其中程序性细胞死亡相关基因;步骤S16:计算基因表达量和细胞类型的相关性,将相关性的基因作为标志物候选基因集;所述肿瘤细胞鉴定模块用于鉴定肿瘤细胞,以所述肿瘤细胞标志物获取模块所得到的肿瘤细胞标记基因作为特征,分别使用多种分类模型鉴定细胞类型,并使用模糊综合评价综合多个模型的预测结果来量化细胞分类结果。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人高精(浙江安吉)精准医学科技有限公司,其通讯地址为:313000 浙江省湖州市安吉县递铺街道半岛中路198号2幢1层40号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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