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龙图腾网恭喜金凤实验室申请的专利单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及存储介质获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN116913389B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-23发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202310673000.7，技术领域涉及：G16B40/00；该发明授权单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及存储介质是由王峥设计研发完成，并于2023-06-07向国家知识产权局提交的专利申请。

本单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及存储介质在说明书摘要公布了：本申请提供一种单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及存储介质。方法包括：获取用户上传的基于单细胞组学产生的第一数据集；基于过滤细胞的指标数据，对第一数据集进行过滤，得到第二数据集，指标数据包括与UMI计数、特征基因计数、线粒体基因百分比和β‑action表达分别对应的阈值范围；调用批效应消除工具，对第二数据集进行批效应消除，得到第三数据集；通过DoubletFinder工具，对第三数据集进行双胞剔除，得到经过预处理而得到的结果数据集。本方案支持tsv、txt、csv、RDS及HDF5等多种格式的数据上传与预处理，能提高预处理的效率及经过处理的数据集的有效性。

本发明授权单细胞转录组数据预处理方法、电子设备及存储介质在权利要求书中公布了：1.一种单细胞转录组数据预处理方法，其特征在于，所述方法包括：获取用户上传的基于单细胞组学产生的第一数据集，所述第一数据集中的数据格式包括tsv格式、txt格式、csv格式、RDS格式及HDF5格式；在接收到预处理指令时，基于用户设置的用于过滤细胞的指标数据，对所述第一数据集进行过滤，得到第二数据集，所述指标数据包括UMI计数的第一阈值范围、特征基因计数的第二阈值范围、线粒体基因百分比的第三阈值范围和与β-action表达对应的第四阈值范围；调用批效应消除工具，对所述第二数据集进行批效应消除，得到第三数据集；通过DoubletFinder工具，对所述第三数据集进行双胞剔除，得到第四数据集，并将所述第四数据集作为经过预处理而得到的结果数据集；将所述结果数据集按预设类别进行分类统计，并对统计得到的分类结果进行页面展示，其中，所述预设类别包括细胞数、特征基因数；其中，基于用户设置的用于过滤细胞的指标数据，对所述第一数据集进行过滤，得到第二数据集，包括：基于用户通过第一条形滑动按钮设置的UMI计数的所述第一阈值范围，滤除所述第一数据集中UMI计数未在所述第一阈值范围内的数据；基于用户通过第二条形滑动按钮设置的特征基因计数的所述第二阈值范围，滤除所述第一数据集中特征基因计数未在所述第二阈值范围内的数据；基于用户通过第三条形滑动按钮设置的线粒体基因百分比的所述第三阈值范围，滤除所述第一数据集中线粒体基因百分比未在所述第三阈值范围内的数据；基于用户通过第四条形滑动按钮设置的与β-action表达对应的所述第四阈值范围，滤除所述第一数据集中β-action表达未在所述第四阈值范围内的数据，其中，在所述第一条形滑动按钮、所述第二条形滑动按钮、所述第三条形滑动按钮以及所述第四条形滑动按钮中，单个条形滑动按钮不同长度对应不同的值；将经过UMI计数、特征基因计数、线粒体基因百分比和β-action表达过滤的第一数据集作为所述第二数据集；通过DoubletFinder工具，对所述第三数据集进行双胞剔除，得到第四数据集，包括：通过所述DoubletFinder工具，从用户预先上传的单细胞数据中随机融合产生人工的模拟双胞；将所述模拟双胞和所述第三数据集中的细胞进行混合，得到混合细胞数据；通过所述DoubletFinder工具中的PCA降维或者PCA距离矩阵，查找每个单元的artificialk最近邻居pANN的比例，其中，所述每个单元为从所述混合细胞数据中划分的一个bin,每个bin包括多个特征基因；基于预设的doublets数量进行所述混合细胞数据的排序，并确定pANN值的阈值；基于所述pANN值的阈值，从所述混合细胞数据中确定双胞数据，并滤除所述双胞数据。

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