恭喜帕特霍奎斯特公司马克·艾利奥特获国家专利权
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龙图腾网恭喜帕特霍奎斯特公司申请的专利区分样品中活微生物和死亡微生物的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN112585283B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-23发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:201980054782.8,技术领域涉及:C12Q1/70;该发明授权区分样品中活微生物和死亡微生物的方法是由马克·艾利奥特;帕斯卡莱·博德莱;史迪文·克吕韦耶设计研发完成,并于2019-06-20向国家知识产权局提交的专利申请。
本区分样品中活微生物和死亡微生物的方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种通过区分样品中具有转录活性的微生物核酸序列和具有转录惰性的微生物核酸序列来区分样品中的活微生物和死亡微生物的方法。具体地,根据本发明的方法基于在存在RNA标记剂的情况下培养的样品中核苷酸取代水平的比较。本发明还涉及一种诊断对象中微生物感染的方法;以及实施根据本发明的区分方法来评估样品污染风险的方法。
本发明授权区分样品中活微生物和死亡微生物的方法在权利要求书中公布了:1.一种用于区分样品中的活微生物和死亡微生物的体外方法,其包括区分样品中具有转录活性的微生物核酸序列和具有转录惰性的微生物核酸序列,所述样品选自环境样品、食品样品或保存培养基,其中所述方法包括以下步骤:a对从样品中提取的RNA组进行测序,其中所述RNA组是通过在RNA标记剂存在的情况下培养样品并进一步通过将所提取的RNA置于允许核苷酸取代的条件下而获得的;从而获得序列读段组;b通过以下方式鉴别至少一个微生物核酸序列命中:i将序列读段或其重叠群与包括微生物核酸序列的数据库进行比对,ii鉴别与至少一个序列读段或其重叠群匹配的至少一个微生物核酸序列命中,和iii通过与数据库的微生物核酸序列匹配的序列读段确定共有微生物核酸序列;c确定与步骤biii确定的共有微生物核酸序列相比,与步骤bii的微生物核酸序列命中匹配的序列读段组或重叠群中经取代的核苷酸的数量和或比率;和d在与步骤bii的至少一个微生物核酸序列命中匹配的序列读段组或重叠群中,如果序列读段组中经胸苷T至胞苷C取代的核苷酸的数量和或比率大于在相同序列读段中所有其他核苷酸的取代的平均数量和或比率,则推断共有微生物核酸序列命中属于活微生物;其中允许核苷酸取代的条件由化学修饰标记的RNA;以及进一步逆转录所述化学修饰的RNA组成。
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